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daodao1129

新虫 (初入文坛)

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虫号: 1437341
注册: 2011-10-11
专业: 土壤生态学

[交流] 土壤微生物多样性测序，选择v3还是v4区，区别是什么？已有2人参与

刚接触土壤微生物测序，看文献有的测序选择了v3区，有的选择了v4区，想请教一下这两个区测出来的结果差别在哪，选择依据是什么，谢谢大家

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1楼 2014-12-26 09:01:22

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微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

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注册: 2014-07-02
性别: MM
专业: 环境微生物学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

这个看你做什么平台，做DGGE的话，做的比较多的是V3区，如果您要做高通量测序平台的话，建议做V4-V5区。V4-V5区高估率比较低。也有做V3-V4区的。

专注微生物多样性分析QQ2758452825

3楼2014-12-26 09:59:23

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肥猫p

木虫 (正式写手)

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专业: 微生物资源与分类学

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

V3，文献都是用的这个

2楼2014-12-26 09:44:26

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