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daodao1129

新虫 (初入文坛)

[交流] 土壤微生物多样性测序,选择v3还是v4区,区别是什么? 已有2人参与

刚接触土壤微生物测序,看文献有的测序选择了v3区,有的选择了v4区,想请教一下这两个区测出来的结果差别在哪,选择依据是什么,谢谢大家
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肥猫p

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
V3,文献都是用的这个
2楼2014-12-26 09:44:26
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微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个看你做什么平台,做DGGE的话,做的比较多的是V3区,如果您要做高通量测序平台的话,建议做V4-V5区。V4-V5区高估率比较低。也有做V3-V4区的。
专注微生物多样性分析QQ2758452825
3楼2014-12-26 09:59:23
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