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cnzpli

金虫 (正式写手)

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[求助] southern blot酶切基因组问题已有2人参与

如题，做southern blot时，在酶切基因组的时候应该用单切还是双酶切？看好多说单酶切，那么单酶切之后探针结合的条带大小为什么会和敲入的基因大小相同？单切应该不可能正好切下来目的片段的啊，切下来大小不一样跑的位置肯定不一样的啊。。。求解！

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1楼 2014-12-03 21:18:46

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沉淀浮躁

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by ksws0465326 at 2014-12-03 22:02:03
做southern的话，我一般都选单酶切，先利用软件查找你要酶切坚定的片段上下游大概5k到10k bp的序列，然后从中确定要是用的霉，因为一个酶在目的基因或者目的基因其上下游都可能存在酶切位点，所以我的话一般都找目的 ...

请问如果没有参考基因组的话，我们该如何查找酶切位点呢？谢谢！

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