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zhangmao511铁虫 (小有名气)
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Gromacs模拟中位置限制性模拟的问题！！
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有个问题想向大家请教一下，关于Gromacs的位置限制性模拟，我在网上看到有2种protocl. Protocl A 是在能量最小化后，先进行位置限制性模拟（也就是将蛋白的所有重原子以1000 kJ/(mol nm2)限制住，打开温度耦合进行100皮秒的模拟），再进行非限制性的NVT，接着进行非限制性的NPT，最后进行production MD. Protocl B是在能量最小化后，进行限制性的NVT 100皮秒，再进行限制性的NPT 100皮秒，最后进行production MD. 这2种Protocl，有没有实质性的区别呢？还是说其实是一样的效果？ 分别用这2种Protocl会会使最后的production MD产生不同的结果吗？十分感谢！  |
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 gromacs | xuexijisuan |
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zhangmao511
铁虫 (小有名气)
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