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51541489

金虫 (小有名气)

[求助] 转录组和表达谱分析求助！

各位大神：
问题1：老师让我做转录组，我是小白，以前没接触过这些，我要做的植物没测序，没基因组信息，想研究它花发育过程中的转录组信息，请问我这样的是不是只用在花发育过程中选取几个时间点取材料送去做转录组就行了啊？不用做表达谱吧，我看做表达谱好像是需要什么Ref做参考，我这个物种没有。
我取了几个时期点做转录组后，是不是就按这几个时期的数据来分析某个基因的表达变化就可以了呢？我看别人都做了表达谱，不知道我这样只作转录组不做表达谱行不行？

问题2：和其他实验室的同学交流后，他们告诉我可以这样做，把不同时期点取的材料RNA提取出来后等量混合，混合后的RNA拿去做转录组，把这个结果作为Ref数据库，然后再做不同时期的表达谱分析，不知道这样做行不行？
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1楼 2014-11-19 20:32:23
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51541489

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 哈斗 at 2014-11-20 11:01:44
1. 没参不能做表达谱，只能做转录组。光看基因表达量差别，属于公司基本分析里面，你不用担心。但是找出目的基因后，深入分析，就要你自己做，或者找高校专门的生物信息学的人帮忙。你可能现在体会不到，到分析时， ...

谢谢帮助啊，我明白了！
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3楼2014-11-21 18:10:38
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哈斗

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2014-11-20 12:58:20
1. 没参不能做表达谱，只能做转录组。光看基因表达量差别，属于公司基本分析里面，你不用担心。但是找出目的基因后，深入分析，就要你自己做，或者找高校专门的生物信息学的人帮忙。你可能现在体会不到，到分析时，自然会明白。
2. 不行。你这样做，文章发不了。测序最忌讳混样本，混了信息就不真实了。不同时间段样本分开测序，一起分析就好。

有说的不对的地方，请包涵
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51541489
2楼2014-11-20 11:01:44
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