应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 细菌基因组测序 成本到底有多少？
331/4返回列表1234下一页
查看: 8564  |  回复: 32
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shellyxss

金虫 (正式写手)

[求助] 细菌基因组测序 成本到底有多少？ 已有8人参与

如题，一上来就是好几万，难道成本真的很高？还是说基因组测序这个行业潜规则就是这样？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Always be curious about nature
1楼 2014-10-21 10:38:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

holyala

木虫 (著名写手)

砖家
★ ★ ★
shellyxss(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-10-24 20:39:31
引用回帖:
5楼: Originally posted by shellyxss at 2014-10-21 12:09:44
我说的是全基因组测序...

二代测序的话，基因组测序一般的市场价是这样的。（实际浮动较大，仅供参考）

核酸提取：200元/样本
文库制备：1000-2000元/样本
上机测序：800~1500元/Gb raw data或clean data
信息分析：1500~3000元/Gb

如果按照5Mb的细菌基因组，测100X的深度，需要大约0.5Gb数据，按照上面的最高价计算（不足1Gb的按1Gb算），一个细菌全基因组测序5700元左右。但是，由于细菌全基因组所需数据量小，不容易凑run，利润空间也比较小，所以很多公司要么不愿意接，要么就把价格打包，报高一点，也是正常的。
赞一下(2人) 回复此楼
21楼2014-10-22 17:26:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

holyala

木虫 (著名写手)

砖家
引用回帖:
21楼: Originally posted by holyala at 2014-10-22 17:26:42
二代测序的话，基因组测序一般的市场价是这样的。（实际浮动较大，仅供参考）

核酸提取：200元/样本
文库制备：1000-2000元/样本
上机测序：800~1500元/Gb raw data或clean data
信息分析：1500~3000元/Gb
...

哈，算错了，最高6700~
赞一下(2人) 回复此楼
22楼2014-10-22 17:28:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

draco1987

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 猪尾巴草 at 2014-10-21 11:07:43
我们实验室送公司测序是800bp,20元

看好了，楼主问的是基因组测序。另外，你个冤大头，我们这里送测一个反应只要花15块。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2014-10-21 15:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
shellyxss(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-10-24 20:39:42
引用回帖:
10楼: Originally posted by shellyxss at 2014-10-21 15:31:30
谢谢了~不过总感觉像潜规则...

不是潜规则。现在测序用的试剂基本依赖国外试剂公司，什么时候能国产化了，价格会便宜很多。我们的Miseq测序仪，很少拿来测基因组（虽然Miseq长度会长些，但不如Hiseq的通量高），成本基本上都花在试剂上。
赞一下(1人) 回复此楼
17楼2014-10-21 19:49:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

猪尾巴草

新虫 (小有名气)
★
myprayer: 金币+1, 鼓励发帖积极交流。 2014-10-21 12:09:12
我们实验室送公司测序是800bp,20元
赞一下 回复此楼
2楼2014-10-21 11:07:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-10-21 12:09:21
shellyxss: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-10-21 12:11:45
基因组测序要保证足够的测序深度，数据量很大，成本高是正常的，随着技术的进步，以后会越来越便宜的。
赞一下 回复此楼
3楼2014-10-21 11:20:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-10-21 12:09:32
shellyxss: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-10-21 12:13:53
基因组测序收费的确很高，测序后还有大量的数据分析。
关键是看你的实验有必要基因组测序吗？
赞一下 回复此楼
4楼2014-10-21 11:22:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 猪尾巴草 at 2014-10-21 11:07:43
我们实验室送公司测序是800bp,20元

我说的是全基因组测序
赞一下 回复此楼
Always be curious about nature
5楼2014-10-21 12:09:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-21 11:20:26
基因组测序要保证足够的测序深度，数据量很大，成本高是正常的，随着技术的进步，以后会越来越便宜的。

成本高是因为需要储存大量的数据嘛？我不太懂
赞一下 回复此楼
Always be curious about nature
6楼2014-10-21 12:11:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by happydove at 2014-10-21 11:22:35
基因组测序收费的确很高，测序后还有大量的数据分析。
关键是看你的实验有必要基因组测序吗？

谢谢你了~
回复此楼
Always be curious about nature
7楼2014-10-21 12:13:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by shellyxss at 2014-10-21 12:11:32
成本高是因为需要储存大量的数据嘛？我不太懂...

主要是测序的试剂成本高. 数据分析的费用另算，收费也不便宜
赞一下 回复此楼
8楼2014-10-21 13:58:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-21 13:58:04
主要是测序的试剂成本高. 数据分析的费用另算，收费也不便宜...

谢谢了~不过总感觉像潜规则
赞一下 回复此楼
Always be curious about nature
10楼2014-10-21 15:31:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shellyxss 的主题更新
331/4返回列表1234下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖？ +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +5 炎黄贵胄 2026-08-22 6/300 2026-08-24 06:34 by sincosx
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭