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化大王文龙

铁虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学模拟中前药分子结构的获得

本人新手,刚接触模拟,现在做聚乙二醇前药稳定性的模拟,在用高斯分别获得聚乙二醇和药物小分子的结构后,人为通过化学键讲二者连接,但是将前药文件输入到PRODRG2网站时  得到的前药结构中,药物小分子的苯环开环了,希望大家能够给予指点,详述如何获得稳定的前药分子模型,以输入Gromacs中进行相关计算。
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Michealfei

新虫 (初入文坛)

请问你用高斯画聚乙二醇怎么画的,我想用聚乙二醇200,结构式怎么画,请大神指点迷津
2楼2018-10-10 15:39:56
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