| 查看: 3705 | 回复: 28 | |||||
starrywang新虫 (正式写手)
|
[求助]
Electron density difference 的sets of atoms 什么意思 已有1人参与
|
||||
|
如题，我知道如何设置sets of atoms ，但是不知道这个是什么意思，算出来的结果我也看不懂，好像有两个单独的castep文件。 另外求教一下下面的图怎么画。该文计算了表面有无吸附物前后的电荷差，然后画出图形。请问，这个电荷是通过什么得到的，光是population的数据是画不出来的吧。   |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 差分电荷密度 | 计算化学 |
» 猜你喜欢
工科材料085601 279求调剂
已经有7人回复
-
【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂
已经有6人回复
-
一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600
已经有4人回复
-
一志愿吉林大学材料学硕321求调剂
已经有14人回复
-
材料学硕297已过四六级求调剂推荐
已经有5人回复
-
材料080500调剂求收留
已经有6人回复
-
296求调剂
已经有7人回复
-
一志愿武汉理工材料工程专硕调剂
已经有7人回复
-
295复试调剂
已经有5人回复
-
一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- castep 计算问题
已经有26人回复
- castep声子计算未知原因失败
已经有20人回复
- 大家帮我看看，我的结果文件有什么问题
已经有3人回复
- [color=Red]k点的选取，怎么算?收敛性测试时怎么变化k点值？[/color]
已经有10人回复
- What is the difference between NAO and ANO?
已经有8人回复
- 【求助】CASTEP中electron density difference中的三个选项的差异？
已经有14人回复
- 【求助】关于电子密度的计算
已经有4人回复
- 【其他】征集第一性原理计算方面牛人的主页【活动结束】
已经有80人回复
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3510.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★ ★ ★ ★
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:25:29
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:25:29
|
差分电荷密度（二次差分，两片段间相互作用前后的电荷密度差）需要指定两个片段具体是那些原子。 差分电荷的定义是△ρ(AB)=ρ(AB)-ρ(A)-ρ(B)，其中ρ(A)、ρ(B)分别都是维持体系AB中A和B的构型，但是体系中，A具体由哪些原子，B具体由哪些原子构成，这个就要指定，set就是指定这个。 如果我们知道了上述定义，那么其实手工计算差分电荷也是可以实现的。只是本人对CASTEP输出的check文件实在是破解不能。。。有个工具叫check2xsf似乎可以转化成cub或是其他格式，这样也许可以输出文本文件用origin作图。如果不限定作图方式，可以通过在MS下建立Slice调整大小后直接截图即可。 |
2楼2014-09-30 21:05:59
starrywang
新虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1854.7
- 散金: 3235
- 红花: 6
- 帖子: 895
- 在线: 223.5小时
- 虫号: 1504446
- 注册: 2011-11-22
- 性别: GG
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
3楼2014-09-30 22:56:13
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3510.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
5楼2014-10-01 00:01:12
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3510.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★ ★ ★ ★
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:25:39
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:25:39
|
1、你可尝试做差分电荷的等值面，类似于电荷密度或前线轨道的等值面那样，然后选择合适的角度截图。 2、electron density difference就可以直接大致判断共价、离子性的特征。布居分析是分析原子电荷的。估计电荷偏向除了布居分析也可以通过电负性均衡原理。 布居分析多种多样，没啥统一性。常规的布居分析操作从简单的例子来看，两原子成键，一部分电荷几乎维持原来的状态，一部分游离于两原子间，这些被共用的电子按照布局分析按一定人为形式划分归属到某个原子，有时候未必完全具有合理性，但容易定量化，对应着电荷密度分布。 |
6楼2014-10-01 00:22:31
starrywang
新虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1854.7
- 散金: 3235
- 红花: 6
- 帖子: 895
- 在线: 223.5小时
- 虫号: 1504446
- 注册: 2011-11-22
- 性别: GG
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
20楼2014-10-03 19:15:41
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3510.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
21楼2014-10-03 19:47:37
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3510.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★ ★ ★
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:27:41
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:27:41
|
木虫论坛有个叫check2xsf的插件，http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5406515&fpage=1&target=blank 你可以下载后（源码的话要编译），之后按照使用说明转换格式即可。对于*.check格式本身是加密的，我就不了解了。另外check文件本身是隐藏的（没记错的话）。 |
24楼2014-10-03 21:02:58
starrywang
新虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1854.7
- 散金: 3235
- 红花: 6
- 帖子: 895
- 在线: 223.5小时
- 虫号: 1504446
- 注册: 2011-11-22
- 性别: GG
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
4楼2014-09-30 23:04:30
starrywang
新虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1854.7
- 散金: 3235
- 红花: 6
- 帖子: 895
- 在线: 223.5小时
- 虫号: 1504446
- 注册: 2011-11-22
- 性别: GG
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
7楼2014-10-01 00:32:29
dxcharlary
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +83 - 1ST强帖: 2
- 应助: 251 (大学生)
- 金币: 10420.1
- 散金: 155
- 红花: 65
- 帖子: 3137
- 在线: 757.6小时
- 虫号: 936718
- 注册: 2010-01-04
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 第一性原理
8楼2014-10-02 19:19:38
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3510.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
9楼2014-10-02 20:42:35
dxcharlary
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +83 - 1ST强帖: 2
- 应助: 251 (大学生)
- 金币: 10420.1
- 散金: 155
- 红花: 65
- 帖子: 3137
- 在线: 757.6小时
- 虫号: 936718
- 注册: 2010-01-04
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 第一性原理
10楼2014-10-02 21:30:18
