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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Electron density difference 的sets of atoms 什么意思
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:26:10
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10楼: Originally posted by dxcharlary at 2014-10-02 21:30:18
我不清楚CASTEP能对电荷密度进行操作，有可能是新版本功能。不过原来只能做单个原子的差分电荷密度。...

现在可以了。以前的话应该原则上应该可以通过check2xsf插件转化成其他格式后对格点文件做差，不过超麻烦。。
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11楼2014-10-02 23:35:49
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starrywang

新虫 (正式写手)
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9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-02 20:42:35
前辈，CASTEP能直接做，两个片段需指定一个片段叫"DensityDifference"即可，然后一次差分和二次差分都能做。
Dmol3能做一次差分，二次差分通过手工对grd文件也可完成。...

弱问一次差分和二次差分分别指什么。

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12楼2014-10-03 01:10:40
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:26:22
引用回帖:
12楼: Originally posted by starrywang at 2014-10-03 01:10:40
弱问一次差分和二次差分分别指什么。
...

形变电荷和差分电荷
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13楼2014-10-03 08:28:16
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starrywang

新虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-03 08:28:16
形变电荷和差分电荷...

这两个在castep中分别对应的是什么选项？

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14楼2014-10-03 10:07:38
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:26:32
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14楼: Originally posted by starrywang at 2014-10-03 10:07:38
这两个在castep中分别对应的是什么选项？
...

一次对应atomic densities
二次对应sets of atoms
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15楼2014-10-03 10:43:04
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starrywang

新虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-03 10:43:04
一次对应atomic densities
二次对应sets of atoms...

原来中文可以这么叫。感谢指点。最近做了几个电荷密度和差分的分布图，固体表面小分子吸附的。希望可以继续得到您指点。

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16楼2014-10-03 11:11:44
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
16楼: Originally posted by starrywang at 2014-10-03 11:11:44
原来中文可以这么叫。感谢指点。最近做了几个电荷密度和差分的分布图，固体表面小分子吸附的。希望可以继续得到您指点。
...

提不上指点，大家多交流
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17楼2014-10-03 11:44:27
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一川烟草

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-03 11:44:27
提不上指点，大家多交流...

请问怎么设置sets of atoms呢？因为选这项后好像还要set一下，但找不到地方…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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18楼2014-10-03 16:57:48
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一川烟草

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-03 10:43:04
一次对应atomic densities
二次对应sets of atoms...

一选sets of atoms就提示这个，没办法了~

Electron density difference 的sets of atoms 什么意思
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19楼2014-10-03 17:08:36
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starrywang

新虫 (正式写手)
★ ★ ★
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:27:15
引用回帖:
19楼: Originally posted by 一川烟草 at 2014-10-03 17:08:36
一选sets of atoms就提示这个，没办法了~

...

终于到我等菜鸡上场的时候了。
edit→edit sets→选中要定义的分子片段→new→命名中需要包含 DensityDifference （你的弹出警示框就是说你set的分子片段名称没有这个DensityDifference）。
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20楼2014-10-03 19:15:41
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