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starrywang新虫 (正式写手)
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Electron density difference 的sets of atoms 什么意思 已有1人参与
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如题，我知道如何设置sets of atoms ，但是不知道这个是什么意思，算出来的结果我也看不懂，好像有两个单独的castep文件。 另外求教一下下面的图怎么画。该文计算了表面有无吸附物前后的电荷差，然后画出图形。请问，这个电荷是通过什么得到的，光是population的数据是画不出来的吧。   |
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franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:27:41
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木虫论坛有个叫check2xsf的插件，http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5406515&fpage=1&target=blank 你可以下载后（源码的话要编译），之后按照使用说明转换格式即可。对于*.check格式本身是加密的，我就不了解了。另外check文件本身是隐藏的（没记错的话）。 |
24楼2014-10-03 21:02:58
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franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:25:29
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差分电荷密度（二次差分，两片段间相互作用前后的电荷密度差）需要指定两个片段具体是那些原子。 差分电荷的定义是△ρ(AB)=ρ(AB)-ρ(A)-ρ(B)，其中ρ(A)、ρ(B)分别都是维持体系AB中A和B的构型，但是体系中，A具体由哪些原子，B具体由哪些原子构成，这个就要指定，set就是指定这个。 如果我们知道了上述定义，那么其实手工计算差分电荷也是可以实现的。只是本人对CASTEP输出的check文件实在是破解不能。。。有个工具叫check2xsf似乎可以转化成cub或是其他格式，这样也许可以输出文本文件用origin作图。如果不限定作图方式，可以通过在MS下建立Slice调整大小后直接截图即可。 |
2楼2014-09-30 21:05:59
starrywang
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3楼2014-09-30 22:56:13
starrywang
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4楼2014-09-30 23:04:30
