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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 急求：ncbi中基因问题
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s53214

铁虫 (正式写手)

[求助] 急求：ncbi中基因问题 已有5人参与

NCBI中查找一个基因后，发现下边有多个mRNA序列，想问下它们之间的区别是什么？
另外，做荧光定量PCR，用CDS还是mRNA作为模板设计引物？
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1楼 2014-09-17 13:37:28
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-17 21:01:24
什么物种？看看有没有基因组数据参考下

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3楼2014-09-17 16:25:03
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JamesZu

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-17 21:01:40
多个mRNA可能是机器预测结果。qPCR的话，肯定是CDS上的序列，最后是中间跨一个内含子，但片段长度不易过长。
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7楼2014-09-17 16:58:35
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普通回帖

bwangel

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-17 21:01:14
多个mRNA，是指多个转录么？

用CDS
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2楼2014-09-17 16:23:31
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happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-17 21:01:32
你用荧光PCR实验做什么呢？拷贝数？表达量？还是什么
建议多看看文献
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4楼2014-09-17 16:46:26
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s53214

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bwangel at 2014-09-17 16:23:31
多个mRNA，是指多个转录么？

用CDS

图中有多个NM-----序列号，我查找的是一个物种的一个基因，点开后查找mRNA就出现图中情况了。另外为什么不用mRNA作为模板呢？
急求：ncbi中基因问题
DQ@R`1H89QM3ELH[KLZX507.jpg
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5楼2014-09-17 16:53:18
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s53214

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by happydove at 2014-09-17 16:46:26
你用荧光PCR实验做什么呢？拷贝数？表达量？还是什么
建议多看看文献

表达量
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6楼2014-09-17 16:54:50
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s53214

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by JamesZu at 2014-09-17 16:58:35
多个mRNA可能是机器预测结果。qPCR的话，肯定是CDS上的序列，最后是中间跨一个内含子，但片段长度不易过长。

NCBI中这个mRNA相差大吗？为什么不用mRNA呢？
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8楼2014-09-17 17:17:10
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JamesZu

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by s53214 at 2014-09-17 17:17:10
NCBI中这个mRNA相差大吗？为什么不用mRNA呢？...

这个没有仔细研究过，你可以看看，估计因为预测算法各异，应该会有一定差异的吧。可以用mRNA序列啊。只是一般测出来都是cDNA的，也就乐得直接使用了！
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9楼2014-09-17 17:20:48
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s53214

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by JamesZu at 2014-09-17 17:20:48
这个没有仔细研究过，你可以看看，估计因为预测算法各异，应该会有一定差异的吧。可以用mRNA序列啊。只是一般测出来都是cDNA的，也就乐得直接使用了！...

那就是mRNA与CDS设计出来的引物差不多？
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10楼2014-09-17 17:24:44
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