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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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s53214

铁虫 (正式写手)

[求助] 急求:ncbi中基因问题 已有5人参与

NCBI中查找一个基因后,发现下边有多个mRNA序列,想问下它们之间的区别是什么?
另外,做荧光定量PCR,用CDS还是mRNA作为模板设计引物?
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Neo2000

木虫 (著名写手)

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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-09-17 21:01:24
什么物种?看看有没有基因组数据参考下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-09-17 16:25:03
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JamesZu

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-09-17 21:01:40
多个mRNA可能是机器预测结果。qPCR的话,肯定是CDS上的序列,最后是中间跨一个内含子,但片段长度不易过长。
7楼2014-09-17 16:58:35
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普通回帖

bwangel

银虫 (小有名气)

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多个mRNA,是指多个转录么?

用CDS
2楼2014-09-17 16:23:31
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happydove

新虫 (小有名气)

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你用荧光PCR实验做什么呢?拷贝数?表达量?还是什么
建议多看看文献
4楼2014-09-17 16:46:26
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s53214

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bwangel at 2014-09-17 16:23:31
多个mRNA,是指多个转录么?

用CDS

图中有多个NM-----序列号,我查找的是一个物种的一个基因,点开后查找mRNA就出现图中情况了。另外为什么不用mRNA作为模板呢?
急求:ncbi中基因问题
DQ@R`1H89QM3ELH[KLZX507.jpg

5楼2014-09-17 16:53:18
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s53214

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by happydove at 2014-09-17 16:46:26
你用荧光PCR实验做什么呢?拷贝数?表达量?还是什么
建议多看看文献

表达量
6楼2014-09-17 16:54:50
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s53214

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by JamesZu at 2014-09-17 16:58:35
多个mRNA可能是机器预测结果。qPCR的话,肯定是CDS上的序列,最后是中间跨一个内含子,但片段长度不易过长。

NCBI中这个mRNA相差大吗?为什么不用mRNA呢?
8楼2014-09-17 17:17:10
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JamesZu

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by s53214 at 2014-09-17 17:17:10
NCBI中这个mRNA相差大吗?为什么不用mRNA呢?...

这个没有仔细研究过,你可以看看,估计因为预测算法各异,应该会有一定差异的吧。可以用mRNA序列啊。只是一般测出来都是cDNA的,也就乐得直接使用了!
9楼2014-09-17 17:20:48
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s53214

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by JamesZu at 2014-09-17 17:20:48
这个没有仔细研究过,你可以看看,估计因为预测算法各异,应该会有一定差异的吧。可以用mRNA序列啊。只是一般测出来都是cDNA的,也就乐得直接使用了!...

那就是mRNA与CDS设计出来的引物差不多?
10楼2014-09-17 17:24:44
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