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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 求教，如何将pdb文件转化为FASTA序列？
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Eckid

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求教，如何将pdb文件转化为FASTA序列？ 已有1人参与

请问有哪些软件能够转化pdb文件为FASTA文件，转化规则也可以，求各位知道方法的帮我解答一下，多谢
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1楼 2014-09-03 23:36:06
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Eckid

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by louis_cheung at 2014-09-03 23:48:59
是蛋白的pdb文件吗？
能打开蛋白pdb文件的软件，大多能显示pdb中所包含的氨基酸序列，然后保存fasta文件就不成问题了。

如果要批量处理的话，可写个程序读取pdb文件里的序列信息后，再按fasta格式自动存为fast ...

你好，请问pdb文件中的序列信息就是存储在SEQRES行的信息么？
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3楼2014-09-07 20:56:34
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匿名

用户注销 (著名写手)
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2楼2014-09-03 23:48:59
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