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Eckid

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求教,如何将pdb文件转化为FASTA序列? 已有1人参与

请问有哪些软件能够转化pdb文件为FASTA文件,转化规则也可以,求各位知道方法的帮我解答一下,多谢
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Eckid

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by louis_cheung at 2014-09-03 23:48:59
是蛋白的pdb文件吗?
能打开蛋白pdb文件的软件,大多能显示pdb中所包含的氨基酸序列,然后保存fasta文件就不成问题了。

如果要批量处理的话,可写个程序读取pdb文件里的序列信息后,再按fasta格式自动存为fast ...

你好,请问pdb文件中的序列信息就是存储在SEQRES行的信息么?
3楼2014-09-07 20:56:34
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匿名

用户注销 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖仅楼主可见
2楼2014-09-03 23:48:59
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