应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 求教，如何将pdb文件转化为FASTA序列？
31/1返回列表
查看: 3791  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Eckid

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求教，如何将pdb文件转化为FASTA序列？ 已有1人参与

请问有哪些软件能够转化pdb文件为FASTA文件，转化规则也可以，求各位知道方法的帮我解答一下，多谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-09-03 23:36:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (著名写手)
感谢参与，应助指数 +1
本帖仅楼主可见
赞一下
2楼2014-09-03 23:48:59
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

Eckid

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by louis_cheung at 2014-09-03 23:48:59
是蛋白的pdb文件吗？
能打开蛋白pdb文件的软件，大多能显示pdb中所包含的氨基酸序列，然后保存fasta文件就不成问题了。

如果要批量处理的话，可写个程序读取pdb文件里的序列信息后，再按fasta格式自动存为fast ...

你好，请问pdb文件中的序列信息就是存储在SEQRES行的信息么？
赞一下 回复此楼
3楼2014-09-07 20:56:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Eckid 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭