| 查看: 4647 | 回复: 4 | ||
anyachan木虫 (小有名气)
|
[求助]
从uniprot中下载的氨基酸序列的fasta格式中的PE,SV分别指什么
|
| 如题，如果能详细地介绍使用uniprot和下载下来的格式都是什么就更好啦，谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有102人回复
-
重要消息，中午系统在维护
已经有6人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有26人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
今天维护系统维护 祝所有人 高中
已经有9人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有16人回复
-
2027广东省杰青
已经有8人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有5人回复
-
投稿咨询
已经有5人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 氨基酸的晶型如何分析出来的，命名方式是啥子
已经有4人回复
- 如何把一个氨基酸序列转化成FASTA格式
已经有7人回复
- 关于uniprot的批量序列下载
已经有14人回复
myibm369
木虫 (正式写手)
~~~~~~~~~~~~~~~~~
- BioEPI: 1
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 3127.1
- 红花: 2
- 帖子: 457
- 在线: 113.8小时
- 虫号: 86473
- 注册: 2005-08-15
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 帮助还是那么有效，继续保持 2013-03-11 08:46:13
anyachan: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2013-03-11 09:10:24
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 帮助还是那么有效，继续保持 2013-03-11 08:46:13
anyachan: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2013-03-11 09:10:24
|
UniProtKB >db|UniqueIdentifier|EntryName ProteinName OS=OrganismName[ GN=GeneName]PE=ProteinExistence SV=SequenceVersion Where: db is 'sp' for UniProtKB/Swiss-Prot and 'tr' for UniProtKB/TrEMBL. UniqueIdentifier is the primary accession number of the UniProtKB entry. EntryName is the entry name of the UniProtKB entry. ProteinName is the recommended name of the UniProtKB entry as annotated in the RecName field. For UniProtKB/TrEMBL entries without a RecName field, the SubName field is used. In case of multiple SubNames, the first one is used. The 'precursor' attribute is excluded, 'Fragment' is included with the name if applicable. OrganismName is the scientific name of the organism of the UniProtKB entry. GeneName is the first gene name of the UniProtKB entry. If there is no gene name, OrderedLocusName or ORFname, the GN field is not listed. ProteinExistence is the numerical value describing the evidence for the existence of the protein. SequenceVersion is the version number of the sequence. Also, you can get more information by http://www.uniprot.org/help/ |
2楼2013-03-10 20:58:27
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24644.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
| 不知道你要的什么格式，FTP上下载的dat的格式在http://web.expasy.org/docs/userman.html |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
anyachan3楼2013-03-11 08:45:26
anyachan
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1830.8
- 帖子: 100
- 在线: 708.3小时
- 虫号: 2032460
- 注册: 2012-09-26
- 性别: MM
- 专业: 药物设计与药物信息
4楼2013-03-11 09:09:55
anyachan
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1830.8
- 帖子: 100
- 在线: 708.3小时
- 虫号: 2032460
- 注册: 2012-09-26
- 性别: MM
- 专业: 药物设计与药物信息
5楼2013-03-11 09:11:40
