| 查看: 2020 | 回复: 2 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
如何在MD动力学模拟过程中固定某些原子的坐标 已有1人参与
|
|||
| 想研究有机分子在金属表面的吸附，做了一个铁的超晶胞作为吸附表面，又做了一个水盒子，里面放了几个有机分子，将两个模型用built>layer组合在一起。用discover的dynamic进行模拟，但模拟后发现，铁原子偏离了其原来的位置，我想让铁原子在MD模拟的过程中固定不动，该怎么做呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
假如你的研究生提出不合理要求
已经有8人回复
-
萌生出自己或许不适合搞科研的想法，现在跑or等等看？
已经有4人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
-
参与限项
已经有3人回复
-
实验室接单子
已经有4人回复
-
全日制（定向）博士
已经有4人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有12人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学模拟时间的意义？
已经有15人回复
- [求助]分子动力学模拟里的系综和温度计算
已经有6人回复
- Vasp相比经典分子动力学的优缺点
已经有11人回复
- 分子动力学模拟与VMD怎么结合
已经有3人回复
- 分子动力学的时间
已经有9人回复
- vmd如何远程加载分子动力学轨迹？
已经有9人回复
- 求MS轨迹文件原子坐标处理方法
已经有3人回复
- 动力学计算过程：时间步长、步数一般设置为多少？
已经有10人回复
- 请教分子力学与分子动力学的区别
已经有14人回复
- VASP分子动力学优化的INCAR如下，怎么CONTCAR和POSCAR没有什么变化啊？
已经有13人回复
- 【求助】分子动力学模拟求扩散系数，最后一步不明白，请求给位大侠。
已经有21人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【讨论】原子和离子动力学过程的程序
已经有24人回复
- 【原创】vasp的分子动力学模拟
已经有44人回复
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2019-08-26 17:20:18
月只蓝
主管区长 (职业作家)
-
专家经验: +1059 - 模拟EPI: 1
- 应助: 1712 (讲师)
- 贵宾: 8.888
- 金币: 68123.7
- 散金: 1938
- 红花: 443
- 沙发: 4
- 帖子: 4373
- 在线: 3291.4小时
- 虫号: 1122189
- 注册: 2010-10-14
- 专业: 宇宙学
- 管辖: 计算模拟区
2楼2014-09-02 16:00:40