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zc_buct

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何在MD动力学模拟过程中固定某些原子的坐标 已有1人参与

想研究有机分子在金属表面的吸附,做了一个铁的超晶胞作为吸附表面,又做了一个水盒子,里面放了几个有机分子,将两个模型用built>layer组合在一起。用discover的dynamic进行模拟,但模拟后发现,铁原子偏离了其原来的位置,我想让铁原子在MD模拟的过程中固定不动,该怎么做呢?
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

选择要固定的原子--MS面板--Modify--Constraints--Fix Cartesian position
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-09-02 16:00:40
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蛤蛤蛤额

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

3楼2019-08-26 17:20:18
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