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东湖渡者

银虫 (小有名气)

[求助] 如何从判断一个蛋白有无糖基化磷酸化,求助理论大牛 已有3人参与

如何从判断一个蛋白有无糖基化磷酸化,求助理论大牛:
1.能否从一个蛋白的功能或者来源上就判断其是否有被N糖基化的可能
2.能否从一个蛋白的功能或者来源上就判断其是否有被O糖基化的可能
3.能否从一个蛋白的功能或者来源上就判断其是否有被磷酸化的可能

人们常说分泌蛋白来自高尔基体,O糖基化是在高尔基体进行。但是当我们拿到一个蛋白假如UNIPROT iD: Q8NHM5 .我们在知道其功能和在细胞内定位的前提下。怎么才能知道以上三条。

我需要将大量蛋白进行分类。我期望能够在前期直接判断某个蛋白是否可能被修饰过。

多谢
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东湖渡者

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by acvhreinlg at 2014-07-17 18:37:26
磷酸化和N糖基化有预测工具,应该比较可信,其糖基化的位点好像ser,O 糖就复杂了,一般要进行质谱鉴定,可以用一些凝集素和抗体检测,功能上不行吧,糖基化很广泛,但这些糖蛋白的功能也不一样,像GPI锚定蛋白好像 ...

被修饰的残基,我做的是从一个蛋白中选择有抗原表位潜力的多肽。
6楼2014-07-21 21:30:02
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查看全部 6 个回答

loveskyzhou

铁虫 (正式写手)

题目太细有难度啊,同求
我会绕一个圈,走回到实验室
2楼2014-07-16 12:51:51
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
东湖渡者: 金币+5, ★有帮助, 牛人,拜读 2014-07-21 21:26:05
请参见:

蛋白质的共价修饰的测定的试验方法-----凌波丽个人总结(实例版)
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6454508

详细内容以后再讨论。

我这个贴子也该再版了。
3楼2014-07-17 03:46:29
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
东湖渡者: 金币+1, ★有帮助, 可能我说的不明白或者你没看清楚我的想法。 2014-07-21 21:26:35
直接质谱分析,拐弯抹角的干什么。
4楼2014-07-17 17:04:16
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