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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 细胞科学 » 如何从判断一个蛋白有无糖基化磷酸化，求助理论大牛
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东湖渡者

银虫 (小有名气)

[求助] 如何从判断一个蛋白有无糖基化磷酸化，求助理论大牛 已有3人参与

如何从判断一个蛋白有无糖基化磷酸化，求助理论大牛：
1.能否从一个蛋白的功能或者来源上就判断其是否有被N糖基化的可能
2.能否从一个蛋白的功能或者来源上就判断其是否有被O糖基化的可能
3.能否从一个蛋白的功能或者来源上就判断其是否有被磷酸化的可能

人们常说分泌蛋白来自高尔基体，O糖基化是在高尔基体进行。但是当我们拿到一个蛋白假如UNIPROT iD: Q8NHM5 .我们在知道其功能和在细胞内定位的前提下。怎么才能知道以上三条。

我需要将大量蛋白进行分类。我期望能够在前期直接判断某个蛋白是否可能被修饰过。

多谢
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1楼 2014-07-16 10:56:40
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loveskyzhou

铁虫 (正式写手)
题目太细有难度啊，同求
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我会绕一个圈，走回到实验室
2楼2014-07-16 12:51:51
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
东湖渡者: 金币+5, ★有帮助, 牛人，拜读 2014-07-21 21:26:05
请参见：

蛋白质的共价修饰的测定的试验方法-----凌波丽个人总结（实例版）
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6454508

详细内容以后再讨论。

我这个贴子也该再版了。
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3楼2014-07-17 03:46:29
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
东湖渡者: 金币+1, ★有帮助, 可能我说的不明白或者你没看清楚我的想法。 2014-07-21 21:26:35
直接质谱分析，拐弯抹角的干什么。
赞一下 回复此楼
4楼2014-07-17 17:04:16
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acvhreinlg

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
东湖渡者: 金币+5, ★有帮助, 谢谢，我这些工具都会用，但是我现在工作性质原因，要处理上千个这样的蛋白。这些软件或者工具的算法很经典，但用这些工具进行预测会错杀很多无修饰的残基或者选择了被修饰过的。 2014-07-21 21:29:01
磷酸化和N糖基化有预测工具，应该比较可信，其糖基化的位点好像ser，O 糖就复杂了，一般要进行质谱鉴定，可以用一些凝集素和抗体检测，功能上不行吧，糖基化很广泛，但这些糖蛋白的功能也不一样，像GPI锚定蛋白好像也是可以预测的，但还是要用特定的酶去水解

[ 发自小木虫客户端 ]
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科研是将金钱转换为知识的过程，而创新则是将知识转换为金钱的过程。
5楼2014-07-17 18:37:26
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东湖渡者

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by acvhreinlg at 2014-07-17 18:37:26
磷酸化和N糖基化有预测工具，应该比较可信，其糖基化的位点好像ser，O 糖就复杂了，一般要进行质谱鉴定，可以用一些凝集素和抗体检测，功能上不行吧，糖基化很广泛，但这些糖蛋白的功能也不一样，像GPI锚定蛋白好像 ...

被修饰的残基，我做的是从一个蛋白中选择有抗原表位潜力的多肽。
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6楼2014-07-21 21:30:02
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