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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 关于引物问题，不懂，请教下！！
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jkamm

金虫 (正式写手)

[求助] 关于引物问题，不懂，请教下！！已有3人参与

我看到文献上要P 某基因产物时，列出上下游引物，但下游引物间却有几个碱基间隔空着，不懂是什么意思，请前辈们帮助 一下，非常感谢！！
如：一对引物是 Car-sp-F: 5'-CGGCTTATTAAGTCAGTTGTGAAATCCTAG-3'
      和 Car-sp-R: 5'-TCCTTCCTCC  CGCTTACACG-3'
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1楼2014-07-15 16:45:22
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duanepp

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jkamm(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-16 08:54:08
你把引物的序列放到blast一下就知道是否能够得到你的目的片段。我blast一下是Cardinium endosymbiont cBtQ1 of Bemisia tabaci partial 16S rRNA gene, isolate F4
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2楼2014-07-16 08:33:27
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laohuwang14

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2014-07-27 20:16:14
估计是作者在文字排列时，无意留下了空格。为了确认该序列是否有缺失，最好的办法是：
用他的引物序列（即你发现有空格的那个序列）作一下Blast （作核苷酸Blast），找到基因的原序列，看是否是有碱基缺失。
希望能解决你的疑问。
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3楼2014-07-16 16:36:04
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-27 20:16:21
软件输出的序列一般每10个碱基加个空格，方便阅读。
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4楼2014-07-21 17:00:45
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