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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps中如何实现两个模拟结果的整合
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tim562944200

金虫 (小有名气)

[求助] lammps中如何实现两个模拟结果的整合 已有2人参与

请教在lammps里 ，能不能把在两个模拟盒里不同物质跑完的结果 ，整合到一个模拟盒里 再接着原来的状态继续模拟啊？比如；两种物质分别单独先跑NPT，然后把他俩的结果综合到一起，一起跑NVT
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1楼 2014-06-14 23:47:40
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tim562944200: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-06-16 08:48:51
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-17 15:54:57
首先，如果你是把两个盒子的物质比较随机的混合的话，感觉你这模型就可能没法让人信服啊。但是如果是两个盒子合并但是不同物质在不同区域进行扩散的话是可以的，一个盒子的放一边。这个很好实现呀，最简单的办法是把第二个的所有坐标在origin里给某个坐标轴加上第一个盒子这个方向的距离。
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2楼2014-06-15 08:36:27
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tim562944200

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhang_jaj at 2014-06-15 08:36:27
首先，如果你是把两个盒子的物质比较随机的混合的话，感觉你这模型就可能没法让人信服啊。但是如果是两个盒子合并但是不同物质在不同区域进行扩散的话是可以的，一个盒子的放一边。这个很好实现呀，最简单的办法是把 ...

我的想法就是想把他们合并放在不同的区域，进行扩散，但你的做法只是把原子的位置整合到了一起，原来的能量、速度等信息都没有了，这个能解决吗？谢谢
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3楼2014-06-15 09:11:52
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tim562944200: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-06-16 08:48:58
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-06-17 15:55:04
引用回帖:
3楼: Originally posted by tim562944200 at 2014-06-15 09:11:52
我的想法就是想把他们合并放在不同的区域，进行扩散，但你的做法只是把原子的位置整合到了一起，原来的能量、速度等信息都没有了，这个能解决吗？谢谢...

两个不同的系统放在一起接着模拟，原来的能量、速度等都会发生改变的，没有必要保留。
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4楼2014-06-16 08:32:03
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superbuff

新虫 (初入文坛)
同问一下：
合并两个data文件的时候，只改坐标还好说，id, type-id, connectivity也要改得话，除了手动修改，有没有什么方便的办法
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时间就是用来浪费的，不是浪在这儿，就得费在那儿！
5楼2015-11-04 06:30:05
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issp-hao

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by superbuff at 2015-11-04 06:30:05
同问一下：
合并两个data文件的时候，只改坐标还好说，id, type-id, connectivity也要改得话，除了手动修改，有没有什么方便的办法

自己写个小程序吧，
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6楼2015-11-05 15:37:57
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