应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps中界面的建立
101/1返回列表
查看: 3830  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

tim562944200

金虫 (小有名气)

[求助] lammps中界面的建立 已有2人参与

想用lammps做一个这样的模拟，两种不同气体，先用npt跑平衡，各自稳定到指定的温度和压力，之后两者放到一个模拟盒里，想求两者界面的性质，请高手指导如何实现？lammps有这种命令吗？或者用region命令能否实现？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-05-12 13:59:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy515258

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 19:58:45
可以输出两个模拟的坐标文件 然后将两个文件的坐标改一下之后写成data文件再让lammps读嘛
赞一下 回复此楼
2楼2014-05-12 16:17:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xy515258 at 2014-05-12 16:17:41
可以输出两个模拟的坐标文件 然后将两个文件的坐标改一下之后写成data文件再让lammps读嘛

这个工作量有点大啊，有没有简单点的，比如我建立一个模拟盒，分成两个region，分别 fix npt,跑一段时间，然后再统一进行nvt
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-12 22:53:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)
自己顶··
回复此楼
4楼2014-05-14 12:44:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy515258

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
tim562944200: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-05-15 11:14:43
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 19:58:51
也可以啊    我看你一开始说要放到一个盒子就以为你是要分开跑         可以定两个group    然后一个group进行fix npt的时候另一个group冻结住    就用fix setforce 0 0 0 吧    或者取消该group原子之间的力也是可以的吧
赞一下 回复此楼
5楼2014-05-14 21:27:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xy515258 at 2014-05-14 21:27:42
也可以啊    我看你一开始说要放到一个盒子就以为你是要分开跑         可以定两个group    然后一个group进行fix npt的时候另一个group冻结住    就用fix setforce 0 0 0 吧    或者取消该group原子之间的力也是可 ...

恩，我也是这么解决的，但是又有一个问题，两边分别跑完之后，我想统一的进行nvt模拟,但是发现提示原子丢失，我认为是分子间势能太大的原因，如果我在跑nvt之前再进行一个能量最小化，会影响前边npt的结果吗？
赞一下 回复此楼
6楼2014-05-15 11:14:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xqyan

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by tim562944200 at 2014-05-15 11:14:30
恩，我也是这么解决的，但是又有一个问题，两边分别跑完之后，我想统一的进行nvt模拟,但是发现提示原子丢失，我认为是分子间势能太大的原因，如果我在跑nvt之前再进行一个能量最小化，会影响前边npt的结果吗？...

我想做一个固体液体固体的夹层结构，分别用两个系统得到液体和固体位形结构，怎么实现两者放到一个系统里呢？？谢~
赞一下 回复此楼
7楼2014-08-27 16:01:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xqyan

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xy515258 at 2014-05-12 16:17:41
可以输出两个模拟的坐标文件 然后将两个文件的坐标改一下之后写成data文件再让lammps读嘛

请问你做过这种两相结构吗~想向您请教些问题
赞一下 回复此楼
8楼2014-08-27 17:06:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见
赞一下
9楼2014-08-29 17:07:21
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见
赞一下
10楼2014-08-29 17:09:17
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
相关版块跳转 我要订阅楼主 tim562944200 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854电子信息求调剂 +3 α____ 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:28 by zhq0425
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 305分求调剂（食品工程） +4 Sxy112 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:26 by 无懈可击111
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +3 vv迷 2026-03-22 3/150 2026-03-22 15:18 by 杨杨杨紫
[考研] 生物学一志愿985，分数349求调剂 +4 zxts12 2026-03-21 7/350 2026-03-22 09:57 by zxts12
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +12 墨墨漠 2026-03-18 13/650 2026-03-21 01:42 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 环境工程调剂 +9 大可digkids 2026-03-16 9/450 2026-03-20 17:38 by 醉在风里
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂（0854都可以） +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭