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jkamm

金虫 (正式写手)

[求助] NCBI在线提交序列遇难题! 已有5人参与

求助!
本人是菜鸟,初次在该网上提交部分线粒体基因序列,进展至Features (Detail)时,提示:Protein Name 要填写,我不懂如何弄了,急死人,周围没人指导,请教各路英雄,如何是好?要将我的核苷序列译成氨基酸或蛋白质序列???不懂,跪求!
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盛夏海棠

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jkamm at 2014-06-11 17:17:56
请问那我是是将类似蛋白质序列copy下就可以吗?不会被审核?...

你只要写上从第几个碱基开始编码就可以,不需要自己翻译成氨基酸,那个系统会自动生成,例如:
<1    >435    gene
                        gene          COI
<1     >435    CDS
                        product       cytochrome c oxidase subunit I
                        codon_start   1
天道酬勤
7楼2014-06-12 08:14:34
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jkamm(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-10 20:48:02
蛋白质名字格式,已上传
http://www.docin.com/p-757939046.html
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-10 19:31:21
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-11 14:14:49
用sequin提交很快的。用DNAman一类的软件把你的核酸翻译成AA就行了
大家相互帮助哈
3楼2014-06-10 21:24:32
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盛夏海棠

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-06-11 14:14:53
蛋白的名字就是你做的线粒体,如COI, COII,可以找个类似的序列做参考来整,不用自己翻译成氨基酸,NCBI会自动给翻译
天道酬勤
4楼2014-06-11 08:52:04
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