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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » NCBI在线提交序列遇难题！
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jkamm

金虫 (正式写手)

[求助] NCBI在线提交序列遇难题！ 已有5人参与

求助！
本人是菜鸟，初次在该网上提交部分线粒体基因序列，进展至Features (Detail)时，提示：Protein Name 要填写，我不懂如何弄了，急死人，周围没人指导，请教各路英雄，如何是好？要将我的核苷序列译成氨基酸或蛋白质序列？？？不懂，跪求！
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1楼 2014-06-10 16:44:14
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jkamm(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-10 20:48:02
蛋白质名字格式，已上传
http://www.docin.com/p-757939046.html
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-10 19:31:21
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-11 14:14:49
用sequin提交很快的。用DNAman一类的软件把你的核酸翻译成AA就行了
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大家相互帮助哈
3楼2014-06-10 21:24:32
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盛夏海棠

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-06-11 14:14:53
蛋白的名字就是你做的线粒体，如COI， COII，可以找个类似的序列做参考来整，不用自己翻译成氨基酸，NCBI会自动给翻译
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天道酬勤
4楼2014-06-11 08:52:04
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jkamm

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 盛夏海棠 at 2014-06-11 08:52:04
蛋白的名字就是你做的线粒体，如COI， COII，可以找个类似的序列做参考来整，不用自己翻译成氨基酸，NCBI会自动给翻译

请问那我是是将类似蛋白质序列copy下就可以吗？不会被审核？
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5楼2014-06-11 17:17:56
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xiayu608

禁虫 (小有名气)
★
感谢参与，应助指数 +1
jkamm(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-12 08:55:02
本帖内容被屏蔽
6楼2014-06-11 18:32:14
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盛夏海棠

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jkamm at 2014-06-11 17:17:56
请问那我是是将类似蛋白质序列copy下就可以吗？不会被审核？...

你只要写上从第几个碱基开始编码就可以，不需要自己翻译成氨基酸，那个系统会自动生成，例如：
<1    >435    gene
                        gene          COI
<1     >435    CDS
                        product       cytochrome c oxidase subunit I
                        codon_start   1
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天道酬勤
7楼2014-06-12 08:14:34
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匿名

用户注销 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
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8楼2014-06-12 10:03:03
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