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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] 关于Martini 力场问题已有1人参与

本人想模拟液相条件下不同的溶液离子对于高聚物分子构象的影响，高聚物分子拟采用粗粒化模型

在这种情况下，溶液离子也必须要粗粒化，Martini 力场好像只包含了H2O和Na+，其它离子

比如K+、Ca2+等等没有包含，请问这种情况下，是需要自己写力场吗？有没有软件可以让

高聚物用粗粒化、溶液离子就用原子，把它们放在一起同时做动力学的？或者有更好的建议

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1楼 2014-06-05 14:46:53

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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
赵红霞: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-06-06 16:41:08
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-06-16 19:35:55

你可以搜索“martini_v2.0_ions.itp”，貌似里面有Ca2+
粗粒化模型中Na+和K+离子差别不大。

2楼2014-06-05 20:41:04

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