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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 请问用什么软件可以模拟气液界面的表面张力
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wxytongxue

银虫 (小有名气)

[求助] 请问用什么软件可以模拟气液界面的表面张力 已有2人参与

请问用什么软件可以模拟气液界面的表面张力~需要知道什么条件？
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1楼 2014-03-23 17:06:27
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huachao90

禁虫 (正式写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-24 19:08:16
本帖内容被屏蔽
2楼2014-03-24 00:23:56
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wxytongxue: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-03-24 16:53:48
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-03-24 19:08:22
1、gromacs就可以，而且处理起来比lammps方便的多

2、“需要知道什么条件？”，需要知道你模拟对象的力场参数和熟悉gromacs手册
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3楼2014-03-24 09:19:26
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wxytongxue

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-03-24 09:19:26
1、gromacs就可以，而且处理起来比lammps方便的多

2、“需要知道什么条件？”，需要知道你模拟对象的力场参数和熟悉gromacs手册

你好，请问你有没有用gromacs计算气液表面张力的算例~我是想对我的实验结果做一个验证~
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4楼2014-03-25 09:27:10
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-25 20:33:39
引用回帖:
4楼: Originally posted by wxytongxue at 2014-03-25 09:27:10
你好，请问你有没有用gromacs计算气液表面张力的算例~我是想对我的实验结果做一个验证~...

我算过martini力场的粗粒化模型的水分子，在水和空气的界面上，表面张力是32mN/m，跟别人算的是一致的，比全原子模型的药小一些
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青青白白123
5楼2014-03-25 10:11:03
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seawind1990

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huachao90 at 2014-03-24 00:23:56
lammps可以的嘛，气象需要模拟的嘛，这个问题我也不是很清楚一起交流交流

同学lammps可以吗？什么思路？
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6楼2015-03-10 10:47:43
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-03-24 09:19:26
1、gromacs就可以，而且处理起来比lammps方便的多

2、“需要知道什么条件？”，需要知道你模拟对象的力场参数和熟悉gromacs手册

GROMACS 是不是可以直接计算 界面张力 呢
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每个人只能陪你走一段路程
7楼2015-12-01 22:09:02
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-03-25 10:11:03
我算过martini力场的粗粒化模型的水分子，在水和空气的界面上，表面张力是32mN/m，跟别人算的是一致的，比全原子模型的药小一些...

也就是说，Gromacs 计算的界面张力比较靠谱吧 ，这个界面张力好计算吗？ Gromacs 常规参数是不是都可以计算呢，例如密度，rdf
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每个人只能陪你走一段路程
8楼2015-12-01 22:10:35
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青青白白123

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-03-25 10:11:03
我算过martini力场的粗粒化模型的水分子，在水和空气的界面上，表面张力是32mN/m，跟别人算的是一致的，比全原子模型的药小一些...

您好，请问gromacs计算张力，您是用的g_energy,直接测出来的吗？您说的32mN/m是对单磷脂分子面积取得平均值吗？
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9楼2018-12-29 11:50:32
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青青白白123

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-03-25 10:11:03
我算过martini力场的粗粒化模型的水分子，在水和空气的界面上，表面张力是32mN/m，跟别人算的是一致的，比全原子模型的药小一些...

因为表面张力是随单磷脂分子面积变化的，谢谢老师！
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10楼2018-12-29 11:59:14
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