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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 怎么用DS做无靶点对接
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a356926674

金虫 (小有名气)

[求助] 怎么用DS做无靶点对接 已有1人参与

如题，现在我手里有一个蛋白，但是我不想通过DS 的寻找靶点进行分子对接，我想用一个小分子跟这个蛋白进行对接，就是不管接到哪里都行，不需要找靶点，这个应该怎么操作？？希望知道的人能帮忙下
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Nothingisimpossible
1楼 2014-06-04 17:57:11
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qianxiong

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢指教 2014-06-11 08:08:18
用autodock 对整个蛋白进行搜索
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戒微博
2楼2014-06-04 19:52:55
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a356926674

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qianxiong at 2014-06-04 19:52:55
用autodock 对整个蛋白进行搜索

。。。。你这个是另外一个软件吧 ，不是DS吧，能说说详细步骤吗？
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Nothingisimpossible
3楼2014-06-05 11:38:18
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qianxiong

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
a356926674: 金币+10, ★有帮助, 不管怎么样，还是非常感谢你 2014-06-07 23:24:51
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-16 19:33:18
具体操作肯定不是几句话能说清楚的。你可以参看autodock教程。
几年前我也接触过DS对接模块，它也是先选定一个对接区域，然后在这个区域做格点计算以及对接。
你选择一个包含整个蛋白的空间作对接区域就可以
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戒微博
4楼2014-06-05 14:36:57
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