24小时热门版块排行榜    

查看: 1335  |  回复: 4

scusmf

铁虫 (初入文坛)

[求助] 没有已知抑制剂的潜在靶点抑制剂筛选

现在有一个潜在靶点,有文章报道这个蛋白和某些癌症有关,蛋白的三维结构已经通过同源建模构建出来。现在想针对这个靶点设计一些抑制剂,最好是筛选一些实体库,如果效果好可以直接购买,现在请问能有哪些计算机药物设计的方法可以用来进行筛选?具体应该怎么做?新手,求各位大神帮帮忙!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

药物设计资料

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jawang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-09-12 21:41:39
scusmf: 金币+10, 有帮助 2012-09-14 09:31:49
如果你现在已经有了三维结构,而且比较确定作用位点的话,可以先使用对接进行化合物库的筛选,对接软件有很多,比如dock,autodock,都是免费的。另外可以给予受体结构进行药效团模型的构建,然后进行筛选。如果目前已经有了很多这个靶点的抑制剂,可以考虑建立qsar模型。实体库可以使用zinc数据库,maybridge等可以买的到的数据库。
2楼2012-09-12 18:47:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

scusmf

铁虫 (初入文坛)

内容已删除
3楼2012-09-13 11:00:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-14 11:53:01
引用回帖:
3楼: Originally posted by scusmf at 2012-09-13 11:00:43
你好,现在主要因为没有这个靶点的抑制剂,用对接的话参数没法参考已知抑制剂设计,药效团也不知道选什么结构,如果直接这样用对接筛选化合物库的话,可信程度会不会太低了。...

虚拟筛选本来就有概率,看你测多少个了,搞高通量筛选的都是测几千上万的,一般能搞出来几十个。虚拟筛选就不少说了
4楼2012-09-13 23:20:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jawang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by scusmf at 2012-09-13 11:00:43
你好,现在主要因为没有这个靶点的抑制剂,用对接的话参数没法参考已知抑制剂设计,药效团也不知道选什么结构,如果直接这样用对接筛选化合物库的话,可信程度会不会太低了。...

这个我觉得需要多建几个模型,同意楼上的观点,虚拟筛选本来就是概率的问题。第一轮的话,估计还是需要多买些结构多样的化合物,然后进行生物实验,等有实验反馈了,才好确定。
5楼2012-09-14 20:43:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 scusmf 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工求调剂 +6 为学666 2026-03-16 6/300 2026-03-17 20:15 by peike
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 7/350 2026-03-17 19:09 by 捣蛋猪猪
[考研] 085600材料与化工求调剂 +5 绪幸与子 2026-03-17 5/250 2026-03-17 16:40 by laoshidan
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 9/450 2026-03-17 10:29 by xujiaoszu
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +8 秋有木北 2026-03-14 8/400 2026-03-16 15:21 by 哦哦123
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:05 by njzyff
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
信息提示
请填处理意见