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scusmf铁虫 (初入文坛)
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没有已知抑制剂的潜在靶点抑制剂筛选
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| 现在有一个潜在靶点,有文章报道这个蛋白和某些癌症有关,蛋白的三维结构已经通过同源建模构建出来。现在想针对这个靶点设计一些抑制剂,最好是筛选一些实体库,如果效果好可以直接购买,现在请问能有哪些计算机药物设计的方法可以用来进行筛选?具体应该怎么做?新手,求各位大神帮帮忙! |
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jawang
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【答案】应助回帖
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scusmf: 金币+10, ★有帮助 2012-09-14 09:31:49
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scusmf: 金币+10, ★有帮助 2012-09-14 09:31:49
| 如果你现在已经有了三维结构,而且比较确定作用位点的话,可以先使用对接进行化合物库的筛选,对接软件有很多,比如dock,autodock,都是免费的。另外可以给予受体结构进行药效团模型的构建,然后进行筛选。如果目前已经有了很多这个靶点的抑制剂,可以考虑建立qsar模型。实体库可以使用zinc数据库,maybridge等可以买的到的数据库。 |
2楼2012-09-12 18:47:54
scusmf
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