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淡到极致

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助】glide 对接的分数是-8.41,可以吗?多少算对接成功?

让别人帮我做的,他也不懂。我想问问,glide对接的分数多少算可以?为什么是负值?
谢谢!
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淡到极致

银虫 (小有名气)


大侠们都还没上班吗?冒个泡泡啊
2楼2010-12-17 14:22:42
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淡到极致

银虫 (小有名气)


是不是金币太少了?如果有人回答,那我再加金币吧
3楼2010-12-17 16:13:47
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ferlich

禁虫 (小有名气)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-23 15:51:19
本帖内容被屏蔽

4楼2010-12-17 16:52:24
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houxuben

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-19 23:02:08
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-23 15:51:25
把蛋白里带的配体抽出或者自己画一个活性高的配体,作为参照,跟你的这个放在一块对接,比较一下SCORE即可
5楼2010-12-19 18:19:13
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淡到极致

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by ferlich at 2010-12-17 16:52:24:
单独看一个对接的话,绝对分数没什么意义

=============================
那分数到底有什么用?怎样知道结果好不好呢?
6楼2010-12-21 22:26:57
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淡到极致

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by houxuben at 2010-12-19 18:19:13:
把蛋白里带的配体抽出或者自己画一个活性高的配体,作为参照,跟你的这个放在一块对接,比较一下SCORE即可

================================
O(∩_∩)O谢谢
这个配体本来就是自己画的,加进去的呀,不太明白你的意思
7楼2010-12-21 22:27:58
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ferlich

禁虫 (小有名气)

★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-23 10:33:41
淡到极致(金币+10):O(∩_∩)O谢谢 2010-12-27 10:03:53
本帖内容被屏蔽

8楼2010-12-22 16:33:53
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houxuben

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-23 11:19:05
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-12-23 15:51:38
引用回帖:
Originally posted by 淡到极致 at 2010-12-21 22:27:58:

================================
O(∩_∩)O谢谢
这个配体本来就是自己画的,加进去的呀,不太明白你的意思

自己画的就不太好比较了,你看看有没有你的靶点有没有protein-ligand 复合物,里面有配体的三维晶体结构,可以用来当做参比分子。要是你自己画的,它的真实三维结构可就不好说了。。。。。还有就是看下说明书,我没用过glide,但是记得surflexdock说明书了说过score大于4是acceptale~祝好运。
9楼2010-12-23 11:15:00
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jumper158

金虫 (正式写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-14 16:36:06
还行,不是很坏,他那个打分时结合能量的一种度量
10楼2011-01-14 13:19:05
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