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淡到极致

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】glide 对接的分数是-8.41，可以吗？多少算对接成功？

让别人帮我做的，他也不懂。我想问问，glide对接的分数多少算可以？为什么是负值？
谢谢！
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1楼 2010-12-17 14:02:37
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淡到极致

银虫 (小有名气)
大侠们都还没上班吗？冒个泡泡啊
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2楼2010-12-17 14:22:42
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淡到极致

银虫 (小有名气)
是不是金币太少了？如果有人回答，那我再加金币吧
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3楼2010-12-17 16:13:47
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ferlich

禁虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-23 15:51:19
本帖内容被屏蔽
4楼2010-12-17 16:52:24
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houxuben

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-19 23:02:08
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-23 15:51:25
把蛋白里带的配体抽出或者自己画一个活性高的配体，作为参照，跟你的这个放在一块对接，比较一下SCORE即可
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-12-19 18:19:13
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淡到极致

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ferlich at 2010-12-17 16:52:24:
单独看一个对接的话，绝对分数没什么意义

=============================
那分数到底有什么用？怎样知道结果好不好呢？
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6楼2010-12-21 22:26:57
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淡到极致

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by houxuben at 2010-12-19 18:19:13:
把蛋白里带的配体抽出或者自己画一个活性高的配体，作为参照，跟你的这个放在一块对接，比较一下SCORE即可

================================
O(∩_∩)O谢谢
这个配体本来就是自己画的，加进去的呀，不太明白你的意思
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7楼2010-12-21 22:27:58
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ferlich

禁虫 (小有名气)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-23 10:33:41
淡到极致(金币+10):O(∩_∩)O谢谢 2010-12-27 10:03:53
本帖内容被屏蔽
8楼2010-12-22 16:33:53
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houxuben

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-23 11:19:05
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-12-23 15:51:38
引用回帖:
Originally posted by 淡到极致 at 2010-12-21 22:27:58:

================================
O(∩_∩)O谢谢
这个配体本来就是自己画的，加进去的呀，不太明白你的意思

自己画的就不太好比较了，你看看有没有你的靶点有没有protein-ligand 复合物，里面有配体的三维晶体结构，可以用来当做参比分子。要是你自己画的，它的真实三维结构可就不好说了。。。。。还有就是看下说明书，我没用过glide，但是记得surflexdock说明书了说过score大于4是acceptale~祝好运。
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9楼2010-12-23 11:15:00
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jumper158

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-14 16:36:06
还行，不是很坏，他那个打分时结合能量的一种度量
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2011-01-14 13:19:05
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