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农田耕者

金虫 (小有名气)

[求助] 请求高手指点:玉米基因启动子序列查找、特定基因上游序列获得方法 已有5人参与

知道了玉米的某一个基因,我现在想了解它的上游序列是什么?请问我如何获得该基因上游启动子区域(起始密码子上游2000bp左右)的序列。请求高手指点一二。
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还行
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grase

捐助贵宾 (职业作家)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
农田耕者(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-05-30 12:59:55
http://blast.maizegdb.org/home.php?a=BLAST_UI
Maize GDB上找吧,全有。
7楼2014-05-30 11:12:34
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
农田耕者(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-05-29 20:35:27
用你的基因在玉米基因组中做blast,找到匹配区后,往前延2000bp就是你的启动子序列。
2楼2014-05-29 16:52:45
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农田耕者

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-29 16:52:45
用你的基因在玉米基因组中做blast,找到匹配区后,往前延2000bp就是你的启动子序列。

能不能再详细一点点,最好有如何往前延伸2000bp的操作步骤
还行
3楼2014-05-29 18:54:31
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
到这里找,NCBI blast 一下就哦了
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
4楼2014-05-29 19:14:52
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