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baiyangnjau

木虫 (正式写手)

[求助] 求助一些在线分析植物线粒体定位的网址,谢谢!已有1人参与

各位大神,有谁知道或经常用一些在线分析植物蛋白亚细胞定位的软件,主要是线粒体定位的网址,谢谢!
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-05-20 23:27:00
baiyangnjau: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-05-21 16:42:01
TargetP(http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)
LocTree3(https://www.rostlab.org/services/loctree2/)
两个网站都能预测蛋白亚细胞定位,LocTree一直在更新,预测速度较慢,预测的更精确,对于真核生物有18个定位区,细菌有6个定位区,古生菌有3个定位区。TargetP现在还是1.1版,貌似很久没有更新了,预测的区域有线粒体、叶绿体、质膜及其他,没有LocTree精细。
2楼2014-05-20 22:04:34
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baiyangnjau

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-20 22:04:34
TargetP(http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)
LocTree3(https://www.rostlab.org/services/loctree2/)
两个网站都能预测蛋白亚细胞定位,LocTree一直在更新,预测速度较慢,预测的更精确,对于真核生物有18 ...

不好意思啊,怎么网站打不开?
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3楼2014-05-21 16:54:40
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by baiyangnjau at 2014-05-21 16:54:40
不好意思啊,怎么网站打不开?...

我这里都是可以用的,应该是你的网络原因。
4楼2014-05-21 17:19:40
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baiyangnjau

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-21 17:19:40
我这里都是可以用的,应该是你的网络原因。...

已经可以了,但是我想问一下,我的预测结果:score 21 ;Expected Accuracy 83%
结果可信度高吗?还有以score为主,还是Expected Accuracy 为主?
努力成为自己想成为的人吧!
5楼2014-05-21 21:00:58
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by baiyangnjau at 2014-05-21 21:00:58
已经可以了,但是我想问一下,我的预测结果:score 21 ;Expected Accuracy 83%
结果可信度高吗?还有以score为主,还是Expected Accuracy 为主?...

score是可信度,在0-100之间,EA是预测准确性,理论上两个值都高比较好,我觉得应该是以可信度为主,不过说回来,毕竟只是一个预测结果。具体可以看网站上的帮助信息或查看相关文献。
6楼2014-05-21 21:29:01
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baiyangnjau

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-21 21:29:01
score是可信度,在0-100之间,EA是预测准确性,理论上两个值都高比较好,我觉得应该是以可信度为主,不过说回来,毕竟只是一个预测结果。具体可以看网站上的帮助信息或查看相关文献。...

好的,谢谢啦!
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7楼2014-05-22 16:15:57
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