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baiyangnjau

木虫 (正式写手)

[求助] 求助一些在线分析植物线粒体定位的网址，谢谢！ 已有1人参与

各位大神，有谁知道或经常用一些在线分析植物蛋白亚细胞定位的软件，主要是线粒体定位的网址，谢谢！
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1楼 2014-05-20 21:48:34
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2014-05-20 23:27:00
baiyangnjau: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-05-21 16:42:01
TargetP(http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)
LocTree3(https://www.rostlab.org/services/loctree2/)
两个网站都能预测蛋白亚细胞定位，LocTree一直在更新，预测速度较慢，预测的更精确，对于真核生物有18个定位区，细菌有6个定位区，古生菌有3个定位区。TargetP现在还是1.1版，貌似很久没有更新了，预测的区域有线粒体、叶绿体、质膜及其他，没有LocTree精细。
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2楼2014-05-20 22:04:34
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baiyangnjau

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-20 22:04:34
TargetP(http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)
LocTree3(https://www.rostlab.org/services/loctree2/)
两个网站都能预测蛋白亚细胞定位，LocTree一直在更新，预测速度较慢，预测的更精确，对于真核生物有18 ...

不好意思啊，怎么网站打不开？
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3楼2014-05-21 16:54:40
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by baiyangnjau at 2014-05-21 16:54:40
不好意思啊，怎么网站打不开？...

我这里都是可以用的，应该是你的网络原因。
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4楼2014-05-21 17:19:40
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baiyangnjau

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-21 17:19:40
我这里都是可以用的，应该是你的网络原因。...

已经可以了，但是我想问一下，我的预测结果：score 21 ；Expected Accuracy 83%
结果可信度高吗？还有以score为主，还是Expected Accuracy 为主？
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5楼2014-05-21 21:00:58
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by baiyangnjau at 2014-05-21 21:00:58
已经可以了，但是我想问一下，我的预测结果：score 21 ；Expected Accuracy 83%
结果可信度高吗？还有以score为主，还是Expected Accuracy 为主？...

score是可信度，在0-100之间，EA是预测准确性，理论上两个值都高比较好，我觉得应该是以可信度为主，不过说回来，毕竟只是一个预测结果。具体可以看网站上的帮助信息或查看相关文献。
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6楼2014-05-21 21:29:01
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baiyangnjau

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-21 21:29:01
score是可信度，在0-100之间，EA是预测准确性，理论上两个值都高比较好，我觉得应该是以可信度为主，不过说回来，毕竟只是一个预测结果。具体可以看网站上的帮助信息或查看相关文献。...

好的，谢谢啦！
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7楼2014-05-22 16:15:57
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