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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

[求助] 已知一个启动子序列,怎么知道它是否为特异性的?已有5人参与

如题,已经获得一个启动子了,想知道它是否为特异性,是通过信息学分析呢还是通过实验?请各位大侠帮帮我这个毫无头绪的初学者吧?学的太差,请大家别笑话!谢谢!
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youlinglyw

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★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-09 22:52:09
引用回帖:
5楼: Originally posted by qiushuimeng at 2014-05-08 17:37:01
谢谢你哈,做序列分析了,没发现什么呢。这位大侠,我说说我的思路你帮我看看对不对哈,假如是某个植物中的启动子,然后想知道它是不是组织特异性,比如是否只在胚珠中表达,可否通过反转录得到这个植株的各 ...

额,这个是一种思路,不过问题在于,你的启动子序列是不表达的啊。事实上,各个组织器官的cdna基本上涵盖了该植物大部分的蛋白表达,除了个别特异性的以外,所以容易出现一个问题就是,你的这个启动子如果不是非常特异的在某个组织表达(比如控制花粉),那么可能会在很多组织都检测出来。
一般我们都会选择主动出击,就是我说的那种克隆或转染。
当然,在这之前,你的方案是个很好而且很简单的思路,比较快捷
如果运气好的话,刚好非常特异,那你就中奖了哈

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天行健
6楼2014-05-08 22:36:05
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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什么物种?你指的特异性是什么意思?
2楼2014-05-08 07:50:21
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youlinglyw

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一匡天下

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-08 12:15:03
生物信息学就是序列分析和对比了
一般情况下,这种应该进行细胞转染实验
用你的启动子去启动一个荧光蛋白,然后看其表达的荧光蛋白分布

如果你是做动物的,那就是要做克隆了,在动物中表达
天行健
3楼2014-05-08 09:48:18
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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meng_xu at 2014-05-08 07:50:21
什么物种?你指的特异性是什么意思?

假如是某个植物中的启动子,然后想知道它是不是组织特异性,比如是否只在胚珠中表达,怎么弄?谢谢
4楼2014-05-08 17:26:19
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