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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 已知一个启动子序列，怎么知道它是否为特异性的？
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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

[求助] 已知一个启动子序列，怎么知道它是否为特异性的？ 已有5人参与

如题，已经获得一个启动子了，想知道它是否为特异性，是通过信息学分析呢还是通过实验？请各位大侠帮帮我这个毫无头绪的初学者吧？学的太差，请大家别笑话！谢谢！
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1楼 2014-05-07 23:38:34
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-05-09 22:52:09
引用回帖:
5楼: Originally posted by qiushuimeng at 2014-05-08 17:37:01
谢谢你哈，做序列分析了，没发现什么呢。这位大侠，我说说我的思路你帮我看看对不对哈，假如是某个植物中的启动子，然后想知道它是不是组织特异性，比如是否只在胚珠中表达，可否通过反转录得到这个植株的各 ...

额，这个是一种思路，不过问题在于，你的启动子序列是不表达的啊。事实上，各个组织器官的cdna基本上涵盖了该植物大部分的蛋白表达，除了个别特异性的以外，所以容易出现一个问题就是，你的这个启动子如果不是非常特异的在某个组织表达（比如控制花粉），那么可能会在很多组织都检测出来。
一般我们都会选择主动出击，就是我说的那种克隆或转染。
当然，在这之前，你的方案是个很好而且很简单的思路，比较快捷
如果运气好的话，刚好非常特异，那你就中奖了哈
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qiushuimeng
天行健
6楼2014-05-08 22:36:05
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
什么物种？你指的特异性是什么意思？
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2楼2014-05-08 07:50:21
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-08 12:15:03
生物信息学就是序列分析和对比了
一般情况下，这种应该进行细胞转染实验
用你的启动子去启动一个荧光蛋白，然后看其表达的荧光蛋白分布

如果你是做动物的，那就是要做克隆了，在动物中表达
赞一下(1人) 回复此楼
天行健
3楼2014-05-08 09:48:18
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qiushuimeng

新虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by meng_xu at 2014-05-08 07:50:21
什么物种？你指的特异性是什么意思？

假如是某个植物中的启动子，然后想知道它是不是组织特异性，比如是否只在胚珠中表达，怎么弄？谢谢
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4楼2014-05-08 17:26:19
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