24小时热门版块排行榜    

查看: 1251  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

[求助] 关于表面的优化 已有2人参与

请教大家一个问题,我是想计算的小分子有机物在pt(111)表面的氧化机理,但是在优化完pt的(111)表面之后就会缺失pt原子,因此就会造成了在原子配对时无法完成配对。不知道该如何解决这个问题。望各位大虫指教!谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 王凯0370 at 2014-05-08 11:40:58
你用的是什么软件啊?MS?VASP?不管哪个软件都应该有界定原子坐标的文件或者什么东西吧。你把你的原子坐标对比一下在切面时的边界条件,看一下是不是超出了边界。我觉得出现这种情况的很大一部分原因就是原子坐标 ...

我用的是MS,那这样会不会影响计算结果,应该不会影响吧,
7楼2014-05-08 15:01:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

王凯0370

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
dongabcde: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-05-08 11:33:58
你看一下POSCAR里的原子是不是超出了边界条件,给算到盒子外边去了。这样的话只要将每一列的坐标加上或减去相同的一个数是原子坐标都回到边界条件里边就行了。但愿能帮到你。
在这个平台里,有问题就问。能解答的问题知无不言、言无不尽
2楼2014-05-08 09:49:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王凯0370 at 2014-05-08 09:49:51
你看一下POSCAR里的原子是不是超出了边界条件,给算到盒子外边去了。这样的话只要将每一列的坐标加上或减去相同的一个数是原子坐标都回到边界条件里边就行了。但愿能帮到你。

谢谢你,不好意思我不知道POSCAR在哪里,原来没有用过呢? 我这里缺失的原子是没有固定的最上面一层边上边界的原子,你看看我的图

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 新建MicrosoftOfficeWord97-2003文档(2).doc
  • 2014-05-08 11:32:12, 96 K
3楼2014-05-08 11:32:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王凯0370 at 2014-05-08 09:49:51
你看一下POSCAR里的原子是不是超出了边界条件,给算到盒子外边去了。这样的话只要将每一列的坐标加上或减去相同的一个数是原子坐标都回到边界条件里边就行了。但愿能帮到你。

谢谢你,不好意思我不知道POSCAR在哪里,原来没有用过呢? 我这里缺失的原子是没有固定的最上面一层边上边界的原子,你看看我的图我下面附上了图
4楼2014-05-08 11:33:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 23/1150 2026-08-15 20:47 by foyo404
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见