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shelay

木虫 (正式写手)

[求助] vasp表面计算的结构优化问题

大家好，我想用vasp计算表面结构的一些性能，我的做法是先做表面结构的优化，再计算性能，优化结构时选择ISIF=3，但是每次都是真空层都优化得没有了（注：真空层厚15A，足够大了），不知道怎么回事啊？
另外我用castep采用基本上一致的参数优化真空层就不会消失，我看论坛里有些同学用ISIF=2或其它，但是我个人认为是不是ISIF=3才是全优化啊，一直为此很纠结，计算也一直没什么进展，请大家不吝赐教，感谢！
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1楼 2012-11-03 16:16:17
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shelay: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-11-04 14:00:00
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教！ 2012-11-04 15:17:11
ISIF=3优化  真空层没有很正常！
如果你创建的slab是asymmetric slab，那需要fix the bottom few layers to estimate the bulk properties，采用ISIF=2 to relax the top few layers。
如果你创建的slab是symmetric slab，那你可以 采用ISIF=3 to relax all the atoms，但是如果体系比较大，那计算量比较大，一般不这么操作。对于symmetric slab模型，一般fix the middle few layer，然后relax 上下 top的few layers。
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从明天开始坚持吃早饭呀！
2楼2012-11-03 21:36:15
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shelay: 金币+1 2012-11-04 14:00:10
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教！ 2012-11-04 15:18:21
对于这种情况应该是用isif=4
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2012-11-04 11:30:11
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shelay

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wzbhit at 2012-11-03 21:36:15
ISIF=3优化  真空层没有很正常！
如果你创建的slab是asymmetric slab，那需要fix the bottom few layers to estimate the bulk properties，采用ISIF=2 to relax the top few layers。
如果你创建的slab是symmetr ...

那固定原子就是在POSCAR文件中设置T或F将其固定吗？以前试过，如果ISIF=3，好像固定不住啊。另外麻烦赐教asymmetric slab和symmetric slab的差别，是不是就是在 bottom 和middle 固定的意思啊？
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4楼2012-11-04 14:14:40
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流， 2012-11-05 14:32:23
shelay: 金币+4 2012-11-05 19:16:41
引用回帖:
4楼: Originally posted by shelay at 2012-11-04 14:14:40
那固定原子就是在POSCAR文件中设置T或F将其固定吗？以前试过，如果ISIF=3，好像固定不住啊。另外麻烦赐教asymmetric slab和symmetric slab的差别，是不是就是在 bottom 和middle 固定的意思啊？...

POSCAR中Selective dynamics关键词是否设置？ 你按照manual上slab的POSCAR设置来就行操作。“ISIF=3且用T F  来选择性fix原子”这个没试过，（感觉没有意义，所以没有尝试），
asymmetric slab和symmetric slab的差别：字面意思很好理解啊，一不对称的slab，一个对称性的slab，不对称性slab，比如你现在构建的直接在Z方向添加15angstrom的真空层，就属于asymmetric slab（此时，fix the bottom few layers）。symmetric slab就是在Z轴正负方向均添加15angstrom真空层。fix the middle few layers。
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从明天开始坚持吃早饭呀！
5楼2012-11-04 20:40:23
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losenq

新虫 (小有名气)
帮顶！！虫子们应该多交流交流！！大家一起成长噻
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6楼2012-11-06 21:02:10
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Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
WDD880227: 金币+1, 多谢指教 2012-11-07 18:55:39
shelay: 金币+22, 1 2012-11-08 20:39:23
含有vacuum的supercell不能用ISIF=3
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7楼2012-11-07 13:05:59
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shelay

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Lathander at 2012-11-07 13:05:59
含有vacuum的supercell不能用ISIF=3

为什么呢？
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8楼2012-11-08 20:40:17
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