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moonoom

银虫 (小有名气)

[求助] 关于DS中的Libdock 已有2人参与

大家好,我使用DS4.0中的Libdock对接一个小分子酶抑制剂,运行完毕后显示0pose,no ligand docked, 请问这是什么原因?请高手多多指点
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珍维永久

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 18:44:58
是不是活性位点没有选择对?
2楼2014-05-05 14:36:03
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supertype

捐助贵宾 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-16 18:45:04
这样情况我也遇到,我发现可能是活性中心定义的太小了,或者配体太大什么的造成。
同样的受体活性中心,一个小的小分子可以对接成功,而一个体积大的小分子的对接就没有结果。
本人遇到的问题权作参考
3楼2014-05-06 16:45:30
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monkeysjl

新虫 (初入文坛)

我也想问一下,我的对接出来也是0pose,扩大半径以后对接的位置跟文献就完全不一样了,不知道是为什么
4楼2018-03-05 01:28:49
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木小萘

新虫 (初入文坛)

5楼2018-03-16 21:42:13
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