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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 关于DS中的Libdock
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moonoom

银虫 (小有名气)

[求助] 关于DS中的Libdock 已有2人参与

大家好，我使用DS4.0中的Libdock对接一个小分子酶抑制剂，运行完毕后显示0pose，no ligand docked， 请问这是什么原因？请高手多多指点
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1楼 2014-05-05 08:50:50
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珍维永久

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 18:44:58
是不是活性位点没有选择对？
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2楼2014-05-05 14:36:03
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supertype

捐助贵宾 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-16 18:45:04
这样情况我也遇到，我发现可能是活性中心定义的太小了，或者配体太大什么的造成。
同样的受体活性中心，一个小的小分子可以对接成功，而一个体积大的小分子的对接就没有结果。
本人遇到的问题权作参考
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3楼2014-05-06 16:45:30
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monkeysjl

新虫 (初入文坛)
我也想问一下，我的对接出来也是0pose，扩大半径以后对接的位置跟文献就完全不一样了，不知道是为什么
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4楼2018-03-05 01:28:49
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木小萘

新虫 (初入文坛)
我也是这样的问题

发自小木虫Android客户端
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5楼2018-03-16 21:42:13
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