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琼脂糖凝胶电泳严重拖尾
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sinky熹
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琼脂糖凝胶电泳严重拖尾
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做的PCR类似巢式PCR,要二轮PCR,之后跑胶结果如图,拖尾的很严重,已经排除是电泳缓冲液和胶的问题了。重复的是以前的实验,但是东西不是一个批次的,模板用的是大半年前的质粒。希望高手指点。。。
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1楼
2014-05-01 15:03:03
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朱多龙
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很有帮助
2014-05-01 15:56:08
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。
2014-05-01 20:43:33
这个现象主要是由于质粒的问题引起的。作为模板的质粒及基因组,时间久了就会出现这种拖尾的现象。DNA片段时间久了会出现一些随机的断裂,就会降低PCR产物的质量。所以还是换一批新的模板,我也会经常遇到这种现象。
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2014-05-01 15:23:08
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sinky熹
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2楼
:
Originally posted by
朱多龙
at 2014-05-01 15:23:08
这个现象主要是由于质粒的问题引起的。作为模板的质粒及基因组,时间久了就会出现这种拖尾的现象。DNA片段时间久了会出现一些随机的断裂,就会降低PCR产物的质量。所以还是换一批新的模板,我也会经常遇到这种现象。
质粒已经摇上了,准备重新提。但是一轮PCR时采用的模板为质粒,第二轮PCR时用的是第一轮PCR的产物,第一轮电泳结果图却很好,会不会还有其他问题?
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2014-05-01 15:41:43
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3楼
:
Originally posted by
sinky熹
at 2014-05-01 15:41:43
质粒已经摇上了,准备重新提。但是一轮PCR时采用的模板为质粒,第二轮PCR时用的是第一轮PCR的产物,第一轮电泳结果图却很好,会不会还有其他问题?...
这也是很正常的啊,有时候片段在质粒上就是比直接用基因片段做模板PCR好啊。这可能是结合的问题,类似酶切位点吧,哈哈。
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4楼
2014-05-01 16:41:53
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sinky熹(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流
2014-05-03 20:31:59
也有可能跟反应体系有关。试试第一轮反应循环数减少,模板也少点,或者稀释后做第二轮模版。
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5楼
2014-05-02 09:56:54
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