| 查看: 1595 | 回复: 1 | ||
vasp001金虫 (正式写手)
|
[求助]
Dmol3 做分子动力学模拟报错 已有1人参与
|
|
Dmol3 做分子动力学模拟报错，错误如下： dq B NaN NaN NaN 0.283886 8.780477 0.969955 dq N NaN NaN NaN -5.353392 6.297291 0.977270 dq B NaN NaN NaN 4.537650 -1.284872 -0.978048 dq N NaN NaN NaN -0.979113 0.453686 -0.468735 dq B NaN NaN NaN 0.778156 -0.938722 -0.368904 dq N NaN NaN NaN 13.823708 -0.334532 -1.320626 dq B NaN NaN NaN -16.458306 1.939333 1.868321 dq N NaN NaN NaN -2.290754 -1.728536 0.630096 dq H NaN NaN NaN 0.524552 0.302119 0.002114 Step System Energy Pot. Energy Temperature MD 1 NaN Ha -2580.2609145 Ha NaN K System Energy is a sum of: Potential = -2580.2609145Ha Kinetic = NaNHa Thermostat = NaNHa Integration points, checksum 0 32634 521540 0.000000 Warning: al_reduce array size =0: doing nothing Warning: al_reduce array size =0: doing nothing Warning: al_reduce array size =0: doing nothing Warning: al_reduce array size =0: doing nothing Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting Error: Overlap matrix is not positive definite. This most likely means the basis set contains linear dependencies. Consider increasing the atomic cutoff parameter or changing the basis set. Error: Overlap matrix is not positive definite. This most likely means the basis set contains linear depende Consider increasing the atomic cutoff parameter or changing Error: buffer size 0, array size = 6432 input 文件如下： # Task parameters Calculate molecular_dynamics Write_HIS_File on Write_ARC_File on MD_Velocity random MD_Time_Step 1.0000 MD_Simann_panel 10000 NVT_NH 300.0000 2.0000 # Symmetry off Max_memory 2048 # Electronic parameters Spin_polarization unrestricted Start_Spin_Populations on 11 1.0000 12 1.0000 charge 0 Basis dnp Pseudopotential none Functional pbe Aux_density octupole Integration_grid fine Occupation thermal 0.0006 Cutoff_Global 3.9000 angstrom Scf_density_convergence 9.0000e-006 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_spin_mixing 0.5000 Scf_iterations 600 Scf_diis 6 pulay # Kpoint definition file (intervals/offset): Kpoints file 1 3 1 0.0000 0.0000 0.0000 6-B3N1-6.kpoints # Calculated properties Mulliken_analysis charge 请问大家有没有什么好的解决方案啊？ |
回复此楼» 猜你喜欢
调剂求收留
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有6人回复
-
336材料求调剂
已经有9人回复
-
341求调剂
已经有7人回复
-
286求调剂
已经有5人回复
-
化学308分求调剂
已经有5人回复
-
0703化学338求调剂！
已经有6人回复
-
求调剂推荐 材料 304
已经有3人回复
-
材料学硕333求调剂
已经有6人回复
-
一志愿郑州大学，080500学硕，总分317分求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学模拟研究课题讨论
已经有13人回复
- Amber 分子动力学 求助！！！！
已经有10人回复
- 关于MS动力学精度设置问题
已经有4人回复
- 分子动力学软件的选择？
已经有8人回复
- 分子动力学模拟 求 水分子的红外光谱
已经有11人回复
- 分子动力学模拟力场
已经有13人回复
- 分子动力学模拟中，随机力的引入
已经有7人回复
- 关于MS做分子动力学的问题
已经有8人回复
- 分子动力学的时间
已经有9人回复
- discover做能量最小化的时候总是计算失败（如图1）
已经有7人回复
- 悲催的第一性原理分子动力学模拟
已经有30人回复
- 分子动力学模拟中的系综问题
已经有5人回复
- 分子动力学模拟完毕之后要怎么分析结果阿
已经有7人回复
- 关于第一性原理和分子动力学模拟，还有ms软件
已经有9人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】有人用Dmol3做过第一性原理分子动力学吗
已经有9人回复
- 【求助】从头算分子动力学模拟 是什么意思？大概的过程是怎么样的？有什么用？谢谢
已经有7人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题
已经有14人回复
- 【原创】vasp的分子动力学模拟
已经有44人回复
mywai520
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 339 (大学生)
- 金币: 10425.6
- 红花: 45
- 帖子: 1664
- 在线: 296.9小时
- 虫号: 265142
- 注册: 2006-07-09
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2014-04-27 20:58:28
