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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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yangjian85

银虫 (初入文坛)

[求助] 悲催的第一性原理分子动力学模拟

博二了,换了个课题,老师让做第一性原理的分子动力学模拟,原来一点基础都没有,什么是第一性原理我都不知道,有哪位大侠可以指点一下,推荐几本书,顺便说一下,老师也给了好几本书,《分组模拟-从算法到应用》《computer simulation of liquids》《计算材料学基础》《VASP教程》可是这基本书我根本就看不懂啊,大侠们都是怎么入门的啊?书里上来就讲什么量子力学,我是不是要先学学量子力学啊,学量子力学需要什么基础啊?急啊 急啊 急啊。对了 另外编程的C语言我也不会,求大侠们指点啊!!!!!!
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 应助指数+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:24:20
很多做计算的也是一点基础都没有的,Take it easy!  一个师兄告诉我说,搞计算入门很简单,两个月学软件,一个月看文献,第四个也就可以开始算了。做研究难的是好的idea,无论实验还是计算!所以建议,还是多读文献,这对博士是最基本的要求。一开始多看些JPCC CPC等档次相对低的文章,对学软件有用,等进阶了读文献的主要精力还是放置PRL JACS Angew N&S这样比较好的杂志上。
不知道你老板怎么推荐你读“《分组模拟-从算法到应用》《computer simulation of liquids》”这样的classic MD的经典书,why not “Ab Initio Molecular Dynamics - Basic Theory and Advanced Methods”!很多ab initio方面书也都涉及到AIMD的,也可以看。
从明天开始坚持吃早饭呀!
10楼2012-11-01 10:40:25
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

你的博士很难正常毕业了。
真理是一点点接近的!
4楼2012-11-01 08:33:09
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xiaofanfan6557

木虫 (小有名气)

老板害人不浅啊,没有基础很难的
5楼2012-11-01 08:59:41
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

难道楼主没有学过量子力学吗?这很危险啊。
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
6楼2012-11-01 09:14:27
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)

有志者

优秀版主优秀版主

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流,, 2013-04-15 21:39:02
建议跟导师沟通,这个不是一时半会学会并发文章的。主要是你连量子力学都不怎么了解。。如果计算这么好发文章,计算方面的同学大发了。。
微博http://weibo.com/10986069
8楼2012-11-01 09:46:42
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souledge

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-11-01 09:14:27
难道楼主没有学过量子力学吗?这很危险啊。

没关系,我在做计算前也没学过,就边学计算边学量子力学,一两年也能够出师啦~
不过LZ要做第一性原理的分子动力学,资源状况估计比较猛~前两天想算个气氛中的分子动力学,不到200个原子,30x30x30的盒子,结果一初始化,16GB内存转瞬消失……于是只好放弃了……T_T 连用CPMD也没能PASS……
思想重于技巧,内涵重于表象
9楼2012-11-01 10:20:19
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-11-01 10:20:19
没关系,我在做计算前也没学过,就边学计算边学量子力学,一两年也能够出师啦~
不过LZ要做第一性原理的分子动力学,资源状况估计比较猛~前两天想算个气氛中的分子动力学,不到200个原子,30x30x30的盒 ...

基本的量子力学和固体能带理论还是要有的嘛
半路出师难度不是一般的大啊
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
12楼2012-11-01 13:57:20
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ssexia

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:25:03
第一性原理很好写文章的,至少从我同学和我看的文章来看,都是算那几个量(弹性模量,比热,形成焓之类的,反正就是力电热方面算几个参数),对象就是不同的化合物,然后用自己算的和前人做的比一比就是了,一样的话就说符合什么的,不一样呢就说模块什么费米能级德拜温度差异什么差异什么的......
而且又不需要做试验,还可以名正言顺的让老板配台好电脑呀。
一般我都是用里面的一些数据来对实验的实际现象进行理论说明。个人认为算出来的这些东西对于实验来说只能算个很基本的参考.....
当然这只是我个人比较粗鄙的想法,请大家别拍我,见谅......
15楼2012-11-01 20:51:53
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solarman

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:24:37
计算还是需要有量子力学基础的,否则只能打打酱油,说真的。
21楼2012-11-02 17:05:55
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by gavinliu7390 at 2012-11-01 08:33:09
你的博士很难正常毕业了。

哈哈哈,我要毕业了。12月答辩,完了走人。
24楼2012-11-07 14:44:24
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Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:24:53
引用回帖:
6楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-11-01 09:14:27
难道楼主没有学过量子力学吗?这很危险啊。

用first principles做research不需要任何量子力学知识,KS equation是怎么回事都不用知道
11楼2012-11-01 11:42:15
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
16楼: Originally posted by aaq2800 at 2012-11-02 08:19:39
如果有师兄带你,软件很快就上手,搞计算入门很简单,两个月学软件,一个月看文献,第四个也就可以开始算了,光看书没用的,看不出啥东西,必须做具体东西,用到什么东西了,再去有目的看书

我的入门可不是这样简单。楼主的老板还会给他几本书看看。我自己找书来看。
17楼2012-11-02 08:44:42
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to_Landau

铁杆木虫 (正式写手)

小木虫

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:24:30
情况不太好啊,主要是时间太紧了,楼主博二,突然换一个全新的方向,难度比较大,何况计算上手本来就比实验慢。
Don'tsquandertime,that'sthestufflifeismadeof.
18楼2012-11-02 09:43:54
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普通回帖
2楼2012-10-31 22:02:01
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Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:24:43
显然应该看molecular dynamics的书,等我找找看我博士老板上课的教材是哪本
3楼2012-11-01 07:12:10
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yangjian85

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-11-01 09:14:27
难道楼主没有学过量子力学吗?这很危险啊。

量子力学是不是很重要啊?
7楼2012-11-01 09:16:34
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