| 查看: 1640 | 回复: 5 | |||
[求助]
如何能在优化后得到这样一个分子模型 已有1人参与
|
这是我画出的初始构型，但一经优化就闭环了 VD9[9EW98O@(`4SKUIT}0@3.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
夏威夷大学生物胶体与界面实验室诚招全奖博士生和博士后
已经有1人回复
-
求助立方晶体In(OH)3的CIF卡片
已经有2人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有152人回复
-
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已经有2人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料
已经有0人回复
-
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建
已经有0人回复
-
[电子教材]天津大学物理化学（第七版）上、下册
已经有1人回复
-
阴离子交换膜电解二氧化碳还原
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何在gaussview中将两个分别优化好的分子放在一个画板中
已经有6人回复
- MOPAC结构优化如何得到分子结构文件
已经有5人回复
- Amorphous Cell建立模型结束，但状态显示Error
已经有9人回复
- 如何画有机分子结构式的长方体模型,得到分子的长宽高
已经有10人回复
- vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起
已经有11人回复
- 用gaussview画出一些分子，若不经过优化，其他软件判断是否稳定存在
已经有12人回复
- 关于晶体优化问题
已经有6人回复
- 如何改变MS中分子模型的二面角
已经有3人回复
- 分子筛球棍模型哪里可以买到
已经有4人回复
- 晶体模型几何优化后，所得结果反而不如未优化的模型
已经有19人回复
- 磷脂双分子层模型怎么建立？
已经有4人回复
- 高斯对多分子体系的构型优化
已经有4人回复
- 【求助】在用MS搭建表面模型时，怎么看出来撘了几层模型呢？？
已经有15人回复
- 【求助】只是优化后文件，没有restart文件，能继续跑吗
已经有22人回复
赵文华110: 回帖置顶 2014-03-06 16:36:32
|
这是一个氧化石墨经还原过后的结构，想要得到一个有缺陷的分子，即石墨环被破坏，中间缺失一个碳，形成缺陷，希望优化后的结构和初始设计想象。这是输入文件%nprocshared=8 %chk=308.chk # opt hf/6-31g geom=connectivity Title Card Required 0 1 C -2.75662176 -1.42112108 -0.00044900 C -1.79784846 -2.43145733 -0.00044900 C -0.43357067 -2.11349205 -0.00044900 C -1.02253818 0.27262550 -0.00038100 C -2.37803562 -0.08064431 -0.00048400 C 0.58753463 -3.12837833 -0.00038400 C 1.35267240 -0.40693108 -0.00019200 C 2.33627079 -1.42988361 -0.00015700 C 1.90461298 -2.80331458 -0.00029500 C 3.69184318 -1.07658817 0.00000000 H 4.45849192 -1.86577353 -0.00003200 C 4.07039509 0.26382442 0.00015100 C 3.11157568 1.27420926 0.00017800 C 1.74735889 0.95625088 -0.00003000 C 0.72619748 1.97112801 -0.00024000 C -0.59086376 1.64606948 -0.00039500 H -1.36879444 2.42508220 -0.00091800 H 1.05226322 3.02266206 -0.00015800 H 0.26133205 -4.17984371 -0.00068000 H -3.82504496 -1.68475874 -0.00071200 H -2.10929247 -3.48668748 -0.00054300 H -3.14464173 0.70854842 -0.00086400 H 2.68245151 -3.58238855 -0.00058200 H 5.13881521 0.52758736 0.00012600 H 3.42312571 2.32943663 0.00019600 1 2 1.5 5 1.5 20 1.0 2 3 2.0 21 1.0 3 6 1.5 4 5 2.0 16 1.5 5 22 1.0 6 9 2.0 19 1.0 7 8 2.0 14 2.0 8 9 1.0 10 1.0 9 23 1.0 10 11 1.0 12 1.5 11 12 13 1.5 24 1.0 13 14 1.0 25 1.0 14 15 1.0 15 16 2.0 18 1.0 16 17 1.0 17 18 19 20 21 22 23 24 25 但优化后的构型为  )ESCH9P[D(I`YGZ7))O6RY0.jpg |
2楼2014-03-05 20:52:59
hdb6522
铜虫 (小有名气)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 756.5
- 帖子: 136
- 在线: 161.7小时
- 虫号: 692415
- 注册: 2009-01-14
- 性别: GG
- 专业: 天然有机化学
3楼2014-03-07 16:13:38
4楼2014-03-08 17:26:23
5楼2014-03-10 16:10:40
6楼2015-03-31 22:18:07