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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 用gaussview画出一些分子，若不经过优化，其他软件判断是否稳定存在
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依然怜悯

木虫 (小有名气)

[求助] 用gaussview画出一些分子，若不经过优化，其他软件判断是否稳定存在

虚心向各位前辈求教：
用gaussview设计一个分子，一般我们会用gauss09去优化，再判断它的真实构型。
但是，若设计的是大分子，由于聚合度比较大，再加之有很多同分异构体，需要的运算量特别大。而且设备较简陋，只有一台计算机，优化一个分子需要等很长时间。
想请问大家，有没有其他软件，或者方法，可以用来 判断这个分子是否设计的合理，是否稳定存在？
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1楼 2013-03-19 19:50:57
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yanrding

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
g09里面也有很多低级别的算法，算起来应该会挺快的吧。
一般总是这样：慢的方法准一些。所以得有个取舍。
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华北电力大学（北京）数理学院，计算化学，凝聚态物理。欢迎合作！招硕士/博士研究生，招老师。
4楼2013-03-19 21:40:57
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
依然怜悯: 金币+2, 今天问了问导师，导师说可行！ 2013-03-21 13:07:08
分子量很大的分子，分子力学已经足够准确。
推荐用g03/09中的UFF或者chemoffice里的MMFF优化。
这种类型的分子不推荐AM1或者PM3/PM6。
虽然分子力学很快，看上去不太准，
但是处理高分子准确度很高。
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5楼2013-03-20 00:42:08
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410894171

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用material studio 可以的啊，就是精度不高些吧
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虫虫……
7楼2013-03-20 09:01:48
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普通回帖

依然怜悯

木虫 (小有名气)
哦，还有，关于Chemdraw，我的笔记本可能系统版本原因，安不上，若有其他方法，更好。谢谢虫友们了。
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2楼2013-03-19 19:57:11
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依然怜悯

木虫 (小有名气)
看了一下，笔记本是W7系统，64位。
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3楼2013-03-19 20:07:12
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witchlq

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
material studio 里面的Forcite模块也可以啊，而且算的速度比较快了。
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6楼2013-03-20 08:30:27
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maynard

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
gaussian在做单点优化速度慢是出了名的，如果有时间学习的话，可以试试molpro这些，据说速度是gaussian的10倍，教程就比gaussian少多了，还都是英文的，当然这两个软件都是要钱的……
chemexper网站可以在线查分子的3D构型，但很遗憾这些构型和我优化出来的还是有点差距的
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8楼2013-03-20 11:45:37
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依然怜悯

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by witchlq at 2013-03-20 08:30:27
material studio 里面的Forcite模块也可以啊，而且算的速度比较快了。

小虫，你觉得forcite板块的精确度怎么样？写论文的时候，有没有说服力？
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9楼2013-03-20 20:55:32
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依然怜悯

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 410894171 at 2013-03-20 09:01:48
用material studio 可以的啊，就是精度不高些吧

恩，我也是担心，会不会有遗漏的同分异构。
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10楼2013-03-20 20:57:38
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