24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 2120  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

依然怜悯

木虫 (小有名气)

[求助] 用gaussview画出一些分子,若不经过优化,其他软件判断是否稳定存在

虚心向各位前辈求教:
用gaussview设计一个分子,一般我们会用gauss09去优化,再判断它的真实构型。
但是,若设计的是大分子,由于聚合度比较大,再加之有很多同分异构体,需要的运算量特别大。而且设备较简陋,只有一台计算机,优化一个分子需要等很长时间。
想请问大家,有没有其他软件,或者方法,可以用来 判断这个分子是否设计的合理,是否稳定存在?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanrding

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
g09里面也有很多低级别的算法,算起来应该会挺快的吧。
一般总是这样:慢的方法准一些。所以得有个取舍。
华北电力大学(北京)数理学院,计算化学,凝聚态物理。欢迎合作!招硕士/博士研究生,招老师。
4楼2013-03-19 21:40:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

依然怜悯

木虫 (小有名气)

哦,还有,关于Chemdraw,我的笔记本可能系统版本原因,安不上,若有其他方法,更好。谢谢虫友们了。
2楼2013-03-19 19:57:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

依然怜悯

木虫 (小有名气)

看了一下,笔记本是W7系统,64位。
3楼2013-03-19 20:07:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
依然怜悯: 金币+2, 今天问了问导师,导师说可行! 2013-03-21 13:07:08
分子量很大的分子,分子力学已经足够准确。
推荐用g03/09中的UFF或者chemoffice里的MMFF优化。
这种类型的分子不推荐AM1或者PM3/PM6。
虽然分子力学很快,看上去不太准,
但是处理高分子准确度很高。
5楼2013-03-20 00:42:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见