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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 用gaussview画出一些分子，若不经过优化，其他软件判断是否稳定存在
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依然怜悯

木虫 (小有名气)

[求助] 用gaussview画出一些分子，若不经过优化，其他软件判断是否稳定存在

虚心向各位前辈求教：
用gaussview设计一个分子，一般我们会用gauss09去优化，再判断它的真实构型。
但是，若设计的是大分子，由于聚合度比较大，再加之有很多同分异构体，需要的运算量特别大。而且设备较简陋，只有一台计算机，优化一个分子需要等很长时间。
想请问大家，有没有其他软件，或者方法，可以用来 判断这个分子是否设计的合理，是否稳定存在？
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1楼2013-03-19 19:50:57
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
依然怜悯: 金币+2, 今天问了问导师，导师说可行！ 2013-03-21 13:07:08
分子量很大的分子，分子力学已经足够准确。
推荐用g03/09中的UFF或者chemoffice里的MMFF优化。
这种类型的分子不推荐AM1或者PM3/PM6。
虽然分子力学很快，看上去不太准，
但是处理高分子准确度很高。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2013-03-20 00:42:08
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yongleli

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 依然怜悯 at 2013-03-20 20:57:38
恩，我也是担心，会不会有遗漏的同分异构。...

构象遍历，用分子力学扫一遍势能面就行了
把所有可能的角度都弄出来，然后扫描。
用Gaussian做要自己写程序；
在ChemOffice里有二面角扫描的选项。
不要问我怎么做，我不做这个很多年
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13楼2013-03-21 23:49:16
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