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亚先

银虫 (小有名气)

[求助] 真菌序列查找 已有3人参与

求助:我已知Lactarius hatsudake红汁乳菇的一段基因序列,想要查找其同源序列并进行对比以设计特异性引物,请问我该如何查找序列?真菌有没有专门的数据库?本人初接触真菌还请大家好心赐教
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变幻自在

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
亚先: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-02-28 16:09:14
zhang8826857: 金币+5, 鼓励新虫,另外,楼主反馈好,奖励。 2014-02-28 19:24:05
http://unite.ut.ee   楼主试试这个网站吧  大部分是子实体的ITS+LSU
5楼2014-02-28 14:08:51
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starflyin

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
亚先(dllchina代发): 金币+1, 鼓励应助 2014-02-28 08:37:50
亚先: 金币+6 2014-02-28 16:09:38
blast不能用?http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
2楼2014-02-27 17:00:20
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亚先

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by starflyin at 2014-02-27 17:00:20
blast不能用?http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

在NCBI上blast找不到同源序列,是不是因为真菌的数据库还不全?
说到做到这就是我的忍道
3楼2014-02-28 13:45:24
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Easony

至尊木虫 (知名作家)

老顽童

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
自信,坚持,善良,真实,简单生活,敢爱敢恨!
4楼2014-02-28 14:02:05
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