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liangpz

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于TAKARA的RT-PCR试剂盒说明书~ 已有3人参与

最近买了TAKARA的RT-PCR试剂盒,RR014A,说明书倒是很详细,但还是有地方不太明白,希望有用过的前辈指点指点啊~~

1  反转录前有个变性退火的过程,65℃    5 min,接着有个4℃,但没说多长时间,是怎么个意思呢?加了反转录酶后的延伸部分也有
同样的问题,只有4℃,没有多长时间~

2  试剂盒里面带的三个反转录引物,Oligo dT Primer,Random 6 mers和Specific Primer,做未知基因的话,前两个之中哪个好一点呢?

3  还有就是PCR部分说明书上写了两步法和三步法,这又是怎么回事?一般不是只有一步法和两步法吗,三步法是什么意思?
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liangpz

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 西瓜 at 2013-12-28 09:26:51
不好意思,第一点是我说错了,看成是最后一步的4℃了。
65℃/5min是让RNA二级结构打开,方便引物的结合;接着的4℃是退火,让引物和RNA互补配对,这一步一般1~5分钟就可以了。...

答案非常清楚,谢谢!~~
还有问题就是,说明书上的反转录体系是10μl,dNTP Mixture是1μl,引物1μl,RNA可能要1.5μl,加RNase Free dH2O 补齐。其中那三个引物任选一种,加1μl,那我用两种的话,该怎么加,加多少呢?

反转录以后不用检测质量吗?该怎么检测呢?
6楼2013-12-28 09:59:21
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liangpz: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2013-12-28 09:52:14
myprayer: 金币+5, MolEPI+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-28 11:42:55
1.4℃是产物保存的温度,4℃前的反应已经结束啦,可以收了。仪器上4℃这步你可以设成无穷大,或者24小时之类的,万一没有及时收,产物在4℃下也能存很久。
2. Specific Primer是针对已知基因专门设计的,试剂盒上应该是没有的哦。 你的是未知基因,Oligo dT Primer和Random 6 mers建议一起用,更容易获得全长的RNA。
3.“PCR部分说明书上写了两步法和三步法”这个是针对PCR程序说的。这里的两步是指退火和延伸用同一个温度,三步则是传统PCR的变性、退火、延伸都用不同温度。两步法因为不用变化温度,PCR耗时相对较短;三步法则可以有效提高反应的特异性和扩增效率。时间充裕的话还是用三步法吧。

你说的一步法和两步法指的是反转录和定量PCR这两个过程是不是在一起。通俗地说,如果你先做反转录,然后取cDNA出来再做定量PCR,这个叫做两步法;如果你一次性把反转录和定量PCR的东西都加到一个管子里,反转录之后不开盖,直接做定量PCR,这个叫做一步法(不是所有试剂盒都能用一步法的哈,不清楚时别乱来)。一步法比较省事,而且不开盖可以降低污染几率,但是反转录出来的cDNA只能用一次,适合土豪;两步法的话比较省东西,得到的cDNA可以多次使用。我建议你用两步法。
2楼2013-12-27 22:21:48
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 西瓜 at 2013-12-27 22:21:48
1.4℃是产物保存的温度,4℃前的反应已经结束啦,可以收了。仪器上4℃这步你可以设成无穷大,或者24小时之类的,万一没有及时收,产物在4℃下也能存很久。
2. Specific Primer是针对已知基因专门设计的,试剂盒上应 ...

大侠 我用的逆转录试剂盒是TAKARA的 DRR025A 我用的是两步法,有个问题想要请教一下在第一步逆转录的时候  有1.30℃ 10min 2.42-50 50-30min  5℃ 5min 请问一下 第1点的30℃ 30Min是做什么用的?第2步的温度是延伸温度么?
生命不息奋斗不止
3楼2013-12-27 22:50:04
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-28 20:53:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by 冷雁孤旅 at 2013-12-27 22:50:04
大侠 我用的逆转录试剂盒是TAKARA的 DRR025A 我用的是两步法,有个问题想要请教一下在第一步逆转录的时候  有1.30℃ 10min 2.42-50 50-30min  5℃ 5min 请问一下 第1点的30℃ 30Min是做什么用的?第2步的温度是延伸 ...

对于原核RNA样品,一般有室温25°C 5-10分钟这一步,而真核RNA样品,一般加酶之前最好对模板进行预变性,70°C左右吧,不同盒子会有些不同。这一步是让模板处于正确状态便于逆转录酶工作的。第二步通常是逆转录酶工作的温度,通常是42°C。之后应该有一步逆转录酶失活,通常是85°C左右,然后降温至4°C。
4楼2013-12-28 07:09:30
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