应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS分子建模求助
51/1返回列表
查看: 3302  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xueyiran2007

铜虫 (小有名气)

[求助] MS分子建模求助 已有3人参与

请各位高人指点，利用ms建模遇到困难，现在都快崩溃了

1. 如何建立球面或弧面模型？
    我的模型中需要建立弧面，我试了一个星期，始终没找到那个模块可以建立弧面

2. 如何将液体分子放到表面上？
    我要模拟液体在金属表面的现象，如何将建好的液体模型放到金属表面上？
    我用Amorphous cell模块建立液体模型，再用adsorption模块将其添加到金属表面时，提示液体模型是周期性的，需要非周期性才能添加上去，
    这个怎么解决？

请各位大神帮小弟一把！菜鸟初学。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
LiveandLearn
1楼 2013-12-19 00:10:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueyiran2007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by Tower.Tsu at 2013-12-20 09:51:31
如果只是图示的弧面还是很容易建模的，先建立一个长方体，在Atom Selection 里面选Radial Distance,设定好位置，半径，就基本可以将不需要的那些原子选定了，删除就好了，当面这样的面是球和长方体的交叉面，还需要 ...

多谢大神！弧面我已经建好了，如上图，怎么把其他分子模型放到弧面上？我用bulid layer对接弧面与其他分子模型，但两者直接由一个空间层，不能达到上图所示的接触效果；我用cleave surface建立平面，建立真空层，利用adsorption模块将分子添加到表面时，提示有周期性，不能添加。

这种情况怎么处理啊？
赞一下 回复此楼
LiveandLearn
10楼2013-12-21 08:27:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-12-19 12:41:16
1、建立什么的弧面模型？最好是画出示意图
如果是模拟液体在不规则金属表面的吸附，你觉得在纳米尺度上，区分弧面和平面有意义吗？圆周长的一种计算就是无限细分以直线近似

2、参考创腾初级教程，CO在Pd100的吸附和聚合物在金属氧化物表面的相互作用
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xueyiran2007
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2013-12-19 09:33:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-12-19 12:41:22
xueyiran2007: 金币+3, ★有帮助 2013-12-21 08:37:14
液滴模型需要编程才能构建, 手动做累死人
去掉周期性就是了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xueyiran2007
3楼2013-12-19 11:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueyiran2007

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-19 09:33:47
1、建立什么的弧面模型？最好是画出示意图
如果是模拟液体在不规则金属表面的吸附，你觉得在纳米尺度上，区分弧面和平面有意义吗？圆周长的一种计算就是无限细分以直线近似

2、参考创腾初级教程，CO在Pd100的吸 ...

多谢大神指点！弧面是肯定要的，因为微观上就是一个弧面，宏观上是平面。
赞一下 回复此楼
LiveandLearn
4楼2013-12-20 04:09:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 EWi2p09MOOv8 2026-08-16 3/150 2026-08-17 16:35 by CBFiACZS7HAK
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +34 医学老男孩 2026-08-13 81/4050 2026-08-17 16:20 by yudaoqian88
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +4 angus9576 2026-08-17 7/350 2026-08-17 16:11 by Vivilian
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +4 基诺咪客 2026-08-17 4/200 2026-08-17 16:10 by Vivilian
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +7 wangze12014 2026-08-14 9/450 2026-08-17 14:59 by wangze12014
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 EWi2p09MOOv8 2026-08-16 6/300 2026-08-17 14:02 by EYK67XJMj64E
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 4/200 2026-08-17 13:49 by EYK67XJMj64E
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 i7NFEVbjQMM5 2026-08-16 4/200 2026-08-17 12:10 by 4GBAYCdVQoK3
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 4/200 2026-08-17 11:46 by 4GBAYCdVQoK3
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭