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sikasun木虫 (正式写手)
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【求助】用MS计算分子半径 已有4人参与
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请问如何用MS得到分子半径？我想知道分子半径，就是把分子包裹起来的最小球体的半径。 我在网上查询和看手册知道MS里，radiussum, centroid, atom column & surface，radius of gyration能计算半径。 centroid可以得到分子的质心，但是半径怎么求？质心到最远的原子的距离吗？好像也不太对；atom column & surface可以求范德华半径和溶剂半径；radiussum是原子形成紧密接触体时的半径；radius of gyration是旋转半径。后三个应该不是我想要的吧。 如果我想求的半径是用centriod来算，应该如何算呢？先画分子，得到稳定构型以后求质心，然后呢？ 我刚开始学习MS不久，不明白的东西很多，先谢谢大家了。 |
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