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sikasun木虫 (正式写手)
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【求助】用MS计算分子半径 已有4人参与
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请问如何用MS得到分子半径?我想知道分子半径,就是把分子包裹起来的最小球体的半径。 我在网上查询和看手册知道MS里,radiussum, centroid, atom column & surface,radius of gyration能计算半径。 centroid可以得到分子的质心,但是半径怎么求?质心到最远的原子的距离吗?好像也不太对;atom column & surface可以求范德华半径和溶剂半径;radiussum是原子形成紧密接触体时的半径;radius of gyration是旋转半径。后三个应该不是我想要的吧。 如果我想求的半径是用centriod来算,应该如何算呢?先画分子,得到稳定构型以后求质心,然后呢? 我刚开始学习MS不久,不明白的东西很多,先谢谢大家了。 |
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9楼2014-09-09 10:33:07
sikasun
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3楼2010-06-18 14:56:53
sikasun
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