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liuheluo

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[求助] 突变位点选择

如题,我有一个酶,有11个cys位点,很容易氧化,我想把部分cys突变掉,但是这个酶的活性位点/三级结构等信息文献没有,想跟各位虫友请教,有没有通用的书籍或者其他资料中涉及到如何选择突变位点及突变成何种氨基酸的?
谢谢。
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuheluo: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-05 16:21:25
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-05 21:04:46
你可以先查一下这些cys的保守性如何。一般功能重要的位点的氨基酸残基会在同源序列间保守。cys可以形成二硫键,突变成任何残基都会破坏功能。但性质差太多的残基可能对结构的影响太大,一般突变成side chain差不多大小的氨基酸,比方说serine
2楼2013-12-05 16:17:45
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liuheluo

捐助贵宾 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-05 16:17:45
你可以先查一下这些cys的保守性如何。一般功能重要的位点的氨基酸残基会在同源序列间保守。cys可以形成二硫键,突变成任何残基都会破坏功能。但性质差太多的残基可能对结构的影响太大,一般突变成side chain差不多大 ...

我blast下,同源性85%的,11个cys全保守,是不是意味着我不能突变这些氨基酸呢?
我想突变主要是因为太容易氧化,酶的稳定性不高。
3楼2013-12-05 16:38:18
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liuheluo at 2013-12-05 16:38:18
我blast下,同源性85%的,11个cys全保守,是不是意味着我不能突变这些氨基酸呢?
我想突变主要是因为太容易氧化,酶的稳定性不高。...

是否会改变功能要做了才知道的。再看看同源性稍差的序列。
4楼2013-12-05 22:30:24
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