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sckcf

铜虫 (小有名气)

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[求助] 请问设计引物前为什么要进行同源性比较？？

如题设计引物前为什么要进行同源性比较？？怎样进行同源性比较。。是和谁比较同源性比较啊？？比较了同源性又怎样根据它设计引物？？？跪求分子高手帮忙？？？

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1楼 2013-11-24 20:38:15

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wangweida2

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-11-25 20:35:01

同源性比较是看引物特异性如何的。比如你是以人类基因组为模板，设计的引物对除了和你扩增的靶点完全配对外，可能还有多个结合位点，这样引物扩增效率会降低，也可能有非特异性产物带。实际操作中，同源性比较没有太大意义，因为正向引物，反向引物同时有非特异性结合位点且片段大小和特异性产物带相近的概率很低，尤其你扩增的还是保守序列。所以不用纠结这个问题，PCR结果不好再分析。