24小时热门版块排行榜    

查看: 1566  |  回复: 3

cuicui2397

新虫 (小有名气)

[求助] vasp中,结构参数优化时,出现错误,求助!谢谢!

侯老师的vasp教程中,针对复杂情况的结构参数优化出现问题,求助!

复杂的情况,以六角结构Mg的晶格常数为例
1.先进行一次体积保持不变的粒子驰豫的计算(ISIF=5)
2再把优化得到的CONTCAR拷贝成POSCAR,进行一次静态的计算
3对a的值取10个左右的点,每个点重复上面两步,得到静态计算下volume-Etot的关系。
这三部的脚步可以通过以下脚本run_cell来进行,内容如下:
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in   5.20  5.23  5.26  5.29 5.32 5.35 5.38  5.41 5.44  5.47
do
cat > POSCAR << !
ureadopef
$i
0                      -1                0
0.8660254        0.5              0
0                      0               1.6230530
2
Direct
0.666666667  0.333333333    0.75
0.333333333  0.666666667    0.25
!
cp INCAR.relax INCAR
echo "a=$i angestrom"; mpiexec -np 8 vasp
cp CONTCAR POSCAR
cp INCAR.static INCAR
echo "a= $i angstrom ";mpiexec -np 8 vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf  "%12.6f \n", $5}'`
V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f \n", $5}'`
echo $V $E >>EtVo.dat
done
4.采用状态方程拟合得到的平衡态下的体积,体弹性模量。
5.在该体积下,重复上面第2步和第3步,得到平衡状态下的其他晶胞参数。这一步也就是:在的到了E(V)曲线后,通过状态方程拟合得到平衡状态下的体积,计算出上面脚本中的变量$i的值,并改变$i的循环值,再运行run_cell计算一次,得到其他的结构参数c和位置u。


我的问题是:在执行sh run.cell命令时,出现错误提示是这样的:
run_cell: line 15: syntax error near unexpected token `newline'
run_cell: line 15: `!'
请问这是什么错误啊?谢谢!我改了改!附近的内容,还是不行。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuicui2397

新虫 (小有名气)

是我自己大意了,已经知道什么错误了。
2楼2013-11-15 20:57:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不要烦恼

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cuicui2397 at 2013-11-15 20:57:12
是我自己大意了,已经知道什么错误了。

您好楼主,我初涉vasp,我在运行这里时候通过状态方程拟合得到平衡状态下的体积,然后如何实现“计算出上面脚本中的变量$i的值,并改变$i的循环值,再运行run_cell计算一次,得到其他的结构参数c和位置u。”呢?
3楼2016-08-30 19:22:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

相丽温

新虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 不要烦恼 at 2016-08-30 19:22:02
您好楼主,我初涉vasp,我在运行这里时候通过状态方程拟合得到平衡状态下的体积,然后如何实现“计算出上面脚本中的变量$i的值,并改变$i的循环值,再运行run_cell计算一次,得到其他的结构参数c和位置u。”呢?...

你好,我也是刚学VASP,不知道你的问题解决了吗?如何实现“计算出上面脚本中的变量$i的值,并改变$i的循环值,再运行run_cell计算一次,得到其他的结构参数c和位置u。”呢?
4楼2016-10-31 18:42:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cuicui2397 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-15 08:07 by xSrQNSSjcgoX
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-15 07:56 by xSrQNSSjcgoX
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 XJXMuRjD7cK7 2026-11-13 3/150 2026-11-15 05:44 by xSrQNSSjcgoX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-13 3/150 2026-11-15 05:11 by xSrQNSSjcgoX
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 7/350 2026-11-15 03:43 by xSrQNSSjcgoX
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 7/350 2026-11-15 03:10 by xSrQNSSjcgoX
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-15 00:24 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-14 22:39 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-14 22:04 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 16:09 by KXypaGgBBlw7
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 5/250 2026-11-13 11:15 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-11 5/250 2026-11-12 11:44 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:38 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 11/550 2026-11-12 09:57 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:08 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:44 by 9fOTqj074tIg
信息提示
请填处理意见